RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 FAM213BQ8TBF2 198 aa19.54■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 DKK4Q9UBT3 224 aa19.54■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 NDRG3Q9UGV2 375 aa19.54■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa19.53■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa19.53■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 TNFSF13O75888 250 aa19.53■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 PEA15Q15121 130 aa19.53■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa19.53■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 Q6ZR03 302 aa19.53■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 Q6ZRM9 215 aa19.53■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 TMEM217Q8N7C4 229 aa19.53■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 ZNF610Q8N9Z0 462 aa19.53■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 FZR1Q9UM11 496 aa19.53■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 IGLV1-44P01699 117 aa19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 CTRB1P17538 263 aa19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 TUBG1P23258 451 aa19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 NFYBP25208 207 aa19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 PPT1P50897 306 aa19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 HFEQ30201 348 aa19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 CTRB2Q6GPI1 263 aa19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 TUBG2Q9NRH3 451 aa19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 PROCRQ9UNN8 238 aa19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 KPTNQ9Y664 436 aa19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 GTF3C1Q12789 2109 aa19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 STARD4Q96DR4 205 aa19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 BCL2L14Q9BZR8 327 aa19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 KCNIP1Q9NZI2 227 aa19.52■□□□□ 0.72
EHD4-202ENST00000569223 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa19.51■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 CGAP01215 116 aa19.51■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 IGKV1-5P01602 117 aa19.51■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 ZNF585BQ52M93 769 aa19.51■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 ACP7Q6ZNF0 438 aa19.51■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 DRAM1Q8N682 238 aa19.51■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 OR1L1Q8NH94 360 aa19.51■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 CACNG5Q9UF02 275 aa19.51■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa19.51■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 A6NLC8 198 aa19.51■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 FABP6P51161 128 aa19.51■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 SLC35E4Q6ICL7 350 aa19.51■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 WDR82Q6UXN9 313 aa19.51■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa19.5■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 PRR14LQ5THK1 2151 aa19.5■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 UMAD1C9J7I0 102 aa19.5■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 OR3A1P47881 315 aa19.5■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 ZNF718Q3SXZ3 478 aa19.5■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 ZADH2Q8N4Q0 377 aa19.5■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 RAB40CQ96S21 281 aa19.5■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 ATP5SQ99766 215 aa19.5■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 MSL2Q9HCI7 577 aa19.5■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 C12orf77C9JDV5 145 aa19.49■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 CD200P41217 278 aa19.49■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa19.49■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 UFSP2Q9NUQ7 469 aa19.49■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 TXNL1O43396 289 aa19.49■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 TFF1P04155 84 aa19.49■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 GCH1P30793 250 aa19.49■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 SEM1Q6ZVN7 128 aa19.49■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 STX12Q86Y82 276 aa19.49■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 LFNGQ8NES3 379 aa19.49■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 PRR7Q8TB68 274 aa19.49■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 A0A1B0GV50 99 aa19.48■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 H3BP45 60 aa19.48■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 AESQ08117 197 aa19.48■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 P2RY6Q15077 328 aa19.48■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 GALMQ96C23 342 aa19.48■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 COQ2Q96H96 371 aa19.48■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 PBDC1Q9BVG4 233 aa19.48■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 OOEPA6NGQ2 149 aa19.47■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 H7C2Y5 167 aa19.47■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 SULT1A1P50225 295 aa19.47■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 RUNX1Q01196 453 aa19.47■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 A0A1B0GW64 132 aa19.47■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 OR5H1A6NKK0 313 aa19.47■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 RNF212BA8MTL3 300 aa19.47■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
EHD4-202ENST00000569223 CEACAM1P13688 526 aa19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms