RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCNDBP1-211ENST00000567434 OR56B1Q8NGI3 324 aa13.58□□□□□ -0.24
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CCNDBP1-211ENST00000567434 LDLRAD4O15165 306 aa13.57□□□□□ -0.24
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CCNDBP1-211ENST00000567434 GNMTQ14749 295 aa13.57□□□□□ -0.24
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CCNDBP1-211ENST00000567434 C2orf76Q3KRA6 126 aa13.57□□□□□ -0.24
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