RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 OR6C3Q9NZP0 311 aa14.65□□□□□ -0.06
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HERC2-208ENST00000566635 CR1LQ2VPA4 569 aa14.65□□□□□ -0.06
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HERC2-208ENST00000566635 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC2-208ENST00000566635 C19orf12Q9NSK7 152 aa14.65□□□□□ -0.06
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HERC2-208ENST00000566635 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.64□□□□□ -0.07
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HERC2-208ENST00000566635 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.63□□□□□ -0.07
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HERC2-208ENST00000566635 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.63□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 J3QKU1 62 aa14.63□□□□□ -0.07
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HERC2-208ENST00000566635 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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HERC2-208ENST00000566635 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 RAB1CQ92928 201 aa14.62□□□□□ -0.07
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HERC2-208ENST00000566635 PHB2Q99623 299 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 GNG12Q9UBI6 72 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 LINC00312Q9Y6C7 94 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 CCSO14618 274 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 IGHV3-7P01780 117 aa14.6□□□□□ -0.07
HERC2-208ENST00000566635 IGHV4-39P01824 125 aa14.6□□□□□ -0.07
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