RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566452.1

BBS2-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-215	ENST00000566452	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	USE1	Q9NZ43	259 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CR1	P17927	2039 aa		2.58	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	HIVEP2	P31629	2446 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	C21orf140	B9A014	251 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CD5L	O43866	347 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	ADAP1	O75689	374 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SLC22A5	O76082	557 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	LY6G6D	O95868	133 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TRBV12-3	P01733	135 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	BCHE	P06276	602 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	DTYMK	P23919	212 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	ZBTB25	P24278	435 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PAX6	P26367	422 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PSMB5	P28074	263 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	ACTR1B	P42025	376 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	GFER	P55789	205 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	OR10A3	P58181	314 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	RAB8A	P61006	207 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CTAG1A	P78358	180 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF235	Q14590	738 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	FBXL22	Q6P050	247 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TAC4	Q86UU9	113 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	NELFB	Q8WX92	580 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	RDH5	Q92781	318 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	WDR34	Q96EX3	536 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	FAM210B	Q96KR6	192 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	RILP	Q96NA2	401 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TIMM17A	Q99595	171 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	NRTN	Q99748	197 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	TMEM100	Q9NV29	134 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	IL17C	Q9P0M4	197 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	RAB22A	Q9UL26	194 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	STAB1	Q9NY15	2570 aa		2.57	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452		A0A0D9SEW6	157 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452		C9J4A7	227 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PHOX2A	O14813	284 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	MPZL2	O60487	215 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	RP2	O75695	350 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	LIMS3	P0CW19	117 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	LIMS4	P0CW20	117 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PSKH1	P11801	424 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF35	P13682	527 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CA7	P43166	264 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PPOX	P50336	477 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	STC1	P52823	247 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	CRADD	P78560	199 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PRSS8	Q16651	343 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	RGS21	Q2M5E4	152 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SLC36A2	Q495M3	483 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	C6orf99	Q4VX62	202 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452		Q6ZS92	163 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	ENKUR	Q8TC29	256 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	FAM104A	Q969W3	186 aa		2.56	□□□□□ -2
BBS2-215	ENST00000566452	PTX4	Q96A99	478 aa		2.56	□□□□□ -2

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