RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558065.1

SEMA4B-204, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEMA4B, Length 3,751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-204ENST00000558065 C5orf47Q569G3 176 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 C1orf210Q8IVY1 113 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 OR5P2Q8WZ92 322 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 PKIBQ9C010 78 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 ST20Q9HBF5 79 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 DOCK11Q5JSL3 2073 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 TRAV27A0A087WT01 109 aa9.46□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 A0A1W2PS18 150 aa9.46□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 VAX1Q5SQQ9 334 aa9.46□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 SPATA46Q5T0L3 261 aa9.46□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF611Q8N823 705 aa9.46□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 CLEC7AQ9BXN2 247 aa9.46□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.46□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 HELTA6NFD8 242 aa9.46□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 C9orf118A6NHY6 69 aa9.46□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 VDAC1P21796 283 aa9.46□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 NPBWR2P48146 333 aa9.46□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 PPP1CBP62140 327 aa9.46□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 PSG4Q00888 419 aa9.46□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.46□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 RAD51DO75771 328 aa9.46□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 RCBTB2O95199 551 aa9.46□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 CMPK1P30085 196 aa9.46□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 GLYATL3Q5SZD4 288 aa9.46□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 ASCL4Q6XD76 172 aa9.46□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 OR2K2Q8NGT1 345 aa9.46□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 UBE2E3Q969T4 207 aa9.46□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 RCHY1Q96PM5 261 aa9.46□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 NECAP2Q9NVZ3 263 aa9.46□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 SCN2AQ99250 2005 aa9.46□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 NCKAP5O14513 1909 aa9.46□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 CEBPZOSA8MTT3 80 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 PITX3O75364 302 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 FOXL1Q12952 345 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 IL13RA2Q14627 380 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 AGTRAPQ6RW13 159 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 KCNS1Q96KK3 526 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 MCHR1Q99705 422 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 A0A087WX48 190 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 METTL12A8MUP2 240 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 CBLN1P23435 193 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF726P1Q15940 193 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 GNB4Q9HAV0 340 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 ANAPC10Q9UM13 185 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 OR52E2Q8NGJ4 325 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 NRTNQ99748 197 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 KXD1Q9BQD3 176 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 PDFQ9HBH1 243 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 LHX3Q9UBR4 397 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 TRPM6Q9BX84 2022 aa9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 GYPAP02724 150 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 GPR1P46091 355 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 POM121L1PQ3SYA9 428 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF787Q6DD87 383 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 OR5D14Q8NGL3 314 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 HBZP02008 142 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 PMCHP20382 165 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 CA7P43166 264 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 RHOBP62745 196 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 ATP5G2Q06055 141 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 FHL1Q13642 323 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 PLCXD3Q63HM9 321 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 SSC4DQ8WTU2 575 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 UTRNP46939 3433 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 NRASP01111 189 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 PSG2P11465 335 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 C19orf35Q6ZS72 473 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF114Q8NC26 417 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 NKD1Q969G9 470 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 GP6Q9HCN6 339 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 B4GALT6Q9UBX8 382 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 CD207Q9UJ71 328 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 INSL5Q9Y5Q6 135 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 COL4A5P29400 1685 aa9.44□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.43□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 SMIM10L1P0DMW3 83 aa9.43□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 ACRV1P26436 265 aa9.43□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 RBMXP38159 391 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SEMA4B-204ENST00000558065 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms