RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 TPPP3Q9BW30 176 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 J3QR06 171 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00271P0C7V0 271 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 U3KQ87 197 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 A6NIN4 97 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 OGG1O15527 345 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 LYG2Q86SG7 212 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 BIVMQ86UB2 503 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 MPDU1O75352 247 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 RAB5BP61020 215 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 PSG9Q00887 426 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 MED9Q9NWA0 146 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 HYPMO75409 117 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 SPDEFO95238 335 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 ISL1P61371 349 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 ERVK11-1P61568 191 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.9□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 H3BMH7 237 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 TCRBP04435 133 aa6.9□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 TET1Q8NFU7 2136 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 C16orf92Q96LL3 132 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 HRH1P35367 487 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 CDS2O95674 445 aa6.9□□□□□ -1.31
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PTPRB-209ENST00000550857 SPCS3P61009 180 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 ZFP82Q8N141 532 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 HSF4Q9ULV5 492 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 SVILO95425 2214 aa6.9□□□□□ -1.31
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PTPRB-209ENST00000550857 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 SSSCA1O60232 199 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 IGKV1D-16P01601 117 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 HBZP02008 142 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 MSMBP08118 114 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 INHBBP09529 407 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 PSMB6P28072 239 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 PAX5Q02548 391 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-209ENST00000550857 FXYD3Q14802 87 aa6.89□□□□□ -1.31
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