RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 FPR2P25090 351 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 INPP1P49441 399 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 CCR6P51684 374 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 TAS2R46P59540 309 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 ARF6P62330 175 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 ASAH1Q13510 395 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 HCP5Q6MZN7 132 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 ZFAND2BQ8WV99 257 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 SIRPDQ9H106 197 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 PALMDQ9NP74 551 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 MCUBQ9NWR8 336 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 OPN4Q9UHM6 478 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 ATRQ13535 2644 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 ZANQ9Y493 2812 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 A0A1W2PPE3 182 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 OR5H14A6NHG9 310 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 TBPP20226 339 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 NFYBP25208 207 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 FCGR2CP31995 323 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 OR3A3P47888 321 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 ZNF134P52741 427 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 AP3S2P59780 193 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 HTD2P86397 168 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 KLRD1Q13241 179 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 PLA1AQ53H76 456 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 ACTBL2Q562R1 376 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 CD276Q5ZPR3 534 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 POC5Q8NA72 575 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 GALMQ96C23 342 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 C5orf30Q96GV9 206 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 TBX15Q96SF7 602 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 OCEL1Q9H607 264 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 RDH8Q9NYR8 311 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 ZNF69Q9UC07 566 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 JPT1Q9UK76 154 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.344e-8■■■■■ 34.1
CS-216ENST00000549221 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 B4DSR2 109 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 M0R1W7 72 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 ST8SIA5O15466 376 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 DIRAS3O95661 229 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 AVPP01185 164 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 PPYP01298 95 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 ZBTB25P24278 435 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 COX7A1P24310 79 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 SLC6A1P30531 599 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 CEACAM6P40199 344 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 GNG10P50151 68 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 FXYD4P59646 89 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 PAX8Q06710 450 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 MEF2DQ14814 521 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 MORN2Q502X0 79 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 PNKDQ8N490 385 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-216ENST00000549221 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms