RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540700.1

UBC-208, Transcript of ubiquitin C, human

TSL 2

Gene UBC, Length 627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBC-208	ENST00000540700	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700		A0A087X0M5	115 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700		A0A1B0GX30	115 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	ODF3B	A8MYP8	253 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	IGHV1-69	P01742	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	GSTT2	P0CG29	244 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	GSTT2B	P0CG30	244 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	DTYMK	P23919	212 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	FPR2	P25090	351 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	NFYB	P25208	207 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	HILS1	P60008	231 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	ARL6IP1	Q15041	203 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	AWAT1	Q58HT5	328 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	PRR31	Q5SQ13	230 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	NANP	Q8TBE9	248 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	SLC31A2	O15432	143 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	EPHA1	P21709	976 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	PAX6	P26367	422 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	CD34	P28906	385 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700		Q6ZS49	121 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	GPX8	Q8TED1	209 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	SNAPC3	Q92966	411 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	NUP50	Q9UKX7	468 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700		V9GYH0	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700		A0A1W2PPE3	182 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	TRDC	B7Z8K6	153 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	TALDO1	P37837	337 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	UBE2E1	P51965	193 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	IGSF11	Q5DX21	431 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	GPR157	Q5UAW9	335 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	ZNF626	Q68DY1	528 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	CCDC190	Q86UF4	302 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	PSG11	Q9UQ72	335 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	NOTCH1	P46531	2555 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	VWF	P04275	2813 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700		A0A1W2PPE2	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700		A0A1W2PR64	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700		A0A1W2PRV1	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	POM121C	A8CG34	1229 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	NPFF	O15130	113 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	FABP7	O15540	132 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	SPINT2	O43291	252 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	IGLV1-47	P01700	117 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	PRSS3	P35030	304 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	GNG10	P50151	68 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	ZNF134	P52741	427 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	DGCR2	P98153	550 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	PITPNA	Q00169	270 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24	8e-7	■□□□□ 10.8
UBC-208	ENST00000540700	OR52W1	Q6IF63	320 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	HOGA1	Q86XE5	327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	OR52I2	Q8NH67	350 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	JMJD8	Q96S16	334 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBC-208	ENST00000540700		A0A0U1RQK1	487 aa		13.52	□□□□□ -0.25
UBC-208	ENST00000540700	ARG1	P05089	322 aa		13.52	□□□□□ -0.25
UBC-208	ENST00000540700	SAA4	P35542	130 aa		13.52	□□□□□ -0.25
UBC-208	ENST00000540700	HTD2	P86397	168 aa		13.52	□□□□□ -0.25
UBC-208	ENST00000540700	ZNF79	Q15937	498 aa		13.52	□□□□□ -0.25
UBC-208	ENST00000540700	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		13.52	□□□□□ -0.25
UBC-208	ENST00000540700	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		13.52	□□□□□ -0.25
UBC-208	ENST00000540700	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		13.52	□□□□□ -0.25
UBC-208	ENST00000540700	JPT1	Q9UK76	154 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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