RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 ADIPOQQ15848 244 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 PSG3Q16557 428 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SUMF1Q8NBK3 374 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 CST9LQ9H4G1 147 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 PRSS50Q9UI38 385 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.78□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 XRCC2O43543 280 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 NME2P22392 152 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 NTF4P34130 210 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 CRYBA4P53673 196 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 GFRA1P56159 465 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 RBPJQ06330 500 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 BATFQ16520 125 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 MKXQ8IYA7 352 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 SARAFQ96BY9 339 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 KLK13Q9UKR3 277 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 GPM6AP51674 278 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 SPSB1Q96BD6 273 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 NTNG2Q96CW9 530 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 SH2D2AQ9NP31 389 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.77□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 E9PLN8 166 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 RAMP3O60896 148 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF205O95201 554 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 OR2C1O95371 312 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 CD5P06127 495 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 S100A10P60903 97 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 HERV-K104P61576 105 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 HIST3H3Q16695 136 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 TEX38Q6PEX7 206 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 NABP1Q96AH0 204 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF75AQ96N20 296 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 PIEZO1Q92508 2521 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 WDR1O75083 606 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF708P17019 499 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF611Q8N823 705 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 MITD1Q8WV92 249 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 TAAR6Q96RI8 345 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF732B4DXR9 585 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 CDIPTO14735 213 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 NGFP01138 241 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 HPNP05981 417 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 TFPI2P48307 235 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 PDLIM4P50479 330 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 PRR27Q6MZM9 219 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF738Q8NE65 137 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 OR4S2Q8NH73 311 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 LYZL4Q96KX0 146 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 SYT3Q9BQG1 590 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM140Q9NV12 185 aa6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.75□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 AGPAT2O15120 278 aa6.75□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 SYNGR3O43761 229 aa6.75□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 CST4P01036 141 aa6.75□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 FUT6P51993 359 aa6.75□□□□□ -1.33
TRPS1-208ENST00000519076 TAS2R46P59540 309 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms