RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 METTL11BQ5VVY1 283 aa12.77□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 CLEC2AQ6UVW9 174 aa12.77□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 LHFPL1Q86WI0 220 aa12.77□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 SPICQ8N5J4 248 aa12.77□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 SECTM1Q8WVN6 248 aa12.77□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 SEC22CQ9BRL7 303 aa12.77□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 MYO9AB2RTY4 2548 aa12.77□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 OTOGQ6ZRI0 2925 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 SLC31A2O15432 143 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 TNFSF12O43508 249 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 NDUFA2O43678 99 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 IGHV2-5P01817 119 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 H2AFB2P0C5Z0 115 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 TBPP20226 339 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ERP29P30040 261 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 GNG10P50151 68 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF134P52741 427 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 LOXL3P58215 753 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00205P59089 165 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 PAX5Q02548 391 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 PHLDA2Q53GA4 152 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ACTBL2Q562R1 376 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 DHRS11Q6UWP2 260 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 MOB1BQ7L9L4 216 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 NLRC3Q7RTR2 1065 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ARRDC1Q8N5I2 433 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 PRRT1Q99946 306 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 MARVELD1Q9BSK0 173 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 GSX2Q9BZM3 304 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 C5orf66Q9H5L9 145 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 MMP26Q9NRE1 261 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 MIOXQ9UGB7 285 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 FAM157AC9JC47 383 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 AKR1C4P17516 323 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 TATDN3Q17R31 274 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 CLEC12BQ2HXU8 276 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 DEFB113Q30KQ7 82 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 LURAP1Q96LR2 239 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 CABLES2Q9BTV7 478 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 SLC2A8Q9NY64 477 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 OR6C3Q9NZP0 311 aa12.76□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 HSD17B6O14756 317 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ST8SIA5O15466 376 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 HEXAP06865 529 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 OR8U9P0C7N5 309 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 PGAM2P15259 253 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 C6orf183Q5T699 404 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 PDZD9Q8IXQ8 264 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 C11orf42Q8N5U0 333 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 OR8U1Q8NH10 309 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 GIMAP1Q8WWP7 306 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ABHD14BQ96IU4 210 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 PIMREGQ9BSJ6 248 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 GNG12Q9UBI6 72 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF69Q9UC07 566 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ALG5Q9Y673 324 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ACANP16112 2415 aa12.75□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 hADV38S2A0JD32 116 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 SPINT2O43291 252 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF714Q96N38 554 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 CCL28Q9NRJ3 127 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF221Q9UK13 617 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00312Q9Y6C7 94 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 CREBBPQ92793 2442 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 VWC2LB2RUY7 222 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 F5H0A9 414 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 GZMHP20718 246 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ZBTB25P24278 435 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ARF6P62330 175 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM230Q96A57 120 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 C5orf30Q96GV9 206 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ONECUT1Q9UBC0 465 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 CR1P17927 2039 aa12.74□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 A0A0A6YYJ9 748 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 TUSC2O75896 110 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 FSTL3O95633 263 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 PPIAL4GP0DN37 164 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 DNASE1P24855 282 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 DLX6P56179 175 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 CR1LQ2VPA4 569 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 ESCO2Q56NI9 601 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 Q5PR19 223 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 CADM3Q8N126 398 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 MOB3AQ96BX8 217 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 PSG11Q9UQ72 335 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 MXRA5Q9NR99 2828 aa12.73□□□□□ -0.37
TRPS1-206ENST00000517323 CSPG4Q6UVK1 2322 aa12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms