RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR11H1Q8NG94 326 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR2Y1Q8NGV0 311 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 ANGPTL6Q8NI99 470 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF563Q8TA94 476 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM45AQ8TCE6 357 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPACA4Q8TDM5 124 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 C16orf78Q8WTQ4 265 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF426Q9BUY5 554 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 PECRQ9BY49 303 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC19A3Q9BZV2 496 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 RAB1BQ9H0U4 201 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 SMDT1Q9H4I9 107 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 MAT2BQ9NZL9 334 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 ENPP5Q9UJA9 477 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLX4Q8IY92 1834 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 ABCB11O95342 1321 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 COL6A6A6NMZ7 2263 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 DSCAMO60469 2012 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 SIGLEC16A6NMB1 481 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 DENRO43583 198 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 ESDP10768 282 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 CTSEP14091 401 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 CD36P16671 472 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 ORM2P19652 201 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCNOP22674 350 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 ACTBP60709 375 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 TSPAN5P62079 268 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 ACTG1P63261 375 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 VAMP3Q15836 100 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 BSXQ3C1V8 233 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC121Q6ZUS5 278 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 VN1R4Q7Z5H5 301 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM75Q8N9X5 138 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR4X2Q8NGF9 303 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR10A6Q8NH74 314 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMIGD2Q96BF3 282 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 GALMQ96C23 342 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 TIMM21Q9BVV7 248 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 XKR8Q9H6D3 395 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 DMAC2Q9NW81 257 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 SCML1Q9UN30 329 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 POFUT2Q9Y2G5 429 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 SCN9AQ15858 1988 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC88CQ9P219 2028 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARRDC5A6NEK1 342 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 C11orf86A6NJI1 115 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 GPR171O14626 319 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 FABP7O15540 132 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 LYNX1P0DP58 116 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC25A16P16260 332 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 AKR1C4P17516 323 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 CD200P41217 278 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 ACTR1BP42025 376 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 PSMD7P51665 324 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 TSPEAR-AS2P59090 65 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 C1QTNF8P60827 252 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC35A2P78381 396 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUMA1Q14980 2115 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 PDK2Q15119 407 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 MAPK14Q16539 360 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 CENPWQ5EE01 88 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 TIMM23BQ5SRD1 257 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 AGTRAPQ6RW13 159 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 RASL11AQ6T310 242 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR4X1Q8NH49 305 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 LRRC20Q8TCA0 184 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 IFT81Q8WYA0 676 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 GTF2H4Q92759 462 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 FGF13Q92913 245 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMBIM1Q969X1 311 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBX5Q99593 518 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 MGLLQ99685 303 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 Q9BRP9 147 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 GTSF1LQ9H1H1 148 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 C11orf1Q9H5F2 150 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 A0A1B0GX12 115 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 DHRS12A0PJE2 317 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 GOLGA8IPA6NC78 632 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-344P-201ENST00000516635 A8MUN3 132 aa0.53□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms