RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489495.5

FUBP1-211, Transcript of far upstream element binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene FUBP1, Length 2,156 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1-211ENST00000489495 HLA-DQA2P01906 255 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 GPX1P07203 203 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF728P0DKX0 622 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 GLI4P10075 376 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 RPS27P42677 84 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PSMB3P49720 205 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 LHX2P50458 406 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PRRX1P54821 245 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TMEM50BP56557 158 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 CLDN15P56746 228 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PIGPP57054 158 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 SELENOVP59797 346 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 YPEL5P62699 121 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 ARG2P78540 354 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 CXCL9Q07325 125 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 HIST3H3Q16695 136 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 FAM78BQ5VT40 261 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 LCN15Q6UWW0 184 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 LINC00696Q6ZRV3 163 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 VASH2Q86V25 355 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF440Q8IYI8 595 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 SAXO1Q8IYX7 474 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 RAB42Q8N4Z0 105 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 ZIC4Q8N9L1 334 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 WFDC5Q8TCV5 224 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 SCGB1C1Q8TD33 95 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TMEM171Q8WVE6 324 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 ASB10Q8WXI3 467 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 C8orf44Q96CB5 159 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 KLHDC3Q9BQ90 382 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TMEM59Q9BXS4 323 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF665Q9H7R5 613 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 MOB1AQ9H8S9 216 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 VDAC3Q9Y277 283 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa3.15□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TMEM265A0A087WTH1 108 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 GRIFINA4D1Z8 144 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 DPRXA6NFQ7 191 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 GRXCR1A8MXD5 290 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 B4DGG1 531 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TEX22C9J3V5 150 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 ADM5C9JUS6 153 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 LATO43561 262 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 MT-CO2P00403 227 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 BGLAPP02818 100 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PNMTP11086 282 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 OMGP23515 440 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 RPS12P25398 132 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 SLC6A8P48029 635 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 EMDP50402 254 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 SERF2P84101 59 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 RUNX1Q01196 453 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 FHL3Q13643 280 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 RTP5Q14D33 572 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 MSMPQ1L6U9 139 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 SP6Q3SY56 376 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 SPIN3Q5JUX0 258 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 C9orf135Q5VTT2 229 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 STUMQ69YW2 141 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 C22orf39Q6P5X5 142 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 C19orf35Q6ZS72 473 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 DEFB128Q7Z7B8 93 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 SLC39A11Q8N1S5 342 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 MTURNQ8N3F0 131 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 DEFB125Q8N687 156 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 CADM4Q8NFZ8 388 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 OR11L1Q8NGX0 322 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 WBP2Q969T9 261 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 UHRF2Q96PU4 802 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 TSPAN32Q96QS1 320 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PIMREGQ9BSJ6 248 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 RSG1Q9BU20 258 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 OR10A2Q9H208 303 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF160Q9HCG1 818 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 NRN1Q9NPD7 142 aa3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
FUBP1-211ENST00000489495 RPRMQ9NS64 109 aa3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.8 ms