RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.48□□□□□ -0.89
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C9orf3-220ENST00000489318 SULT1A4P0DMN0 295 aa9.48□□□□□ -0.89
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C9orf3-220ENST00000489318 SSTR2P30874 369 aa9.48□□□□□ -0.89
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C9orf3-220ENST00000489318 AGMATQ9BSE5 352 aa9.46□□□□□ -0.9
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C9orf3-220ENST00000489318 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-220ENST00000489318 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
C9orf3-220ENST00000489318 DOCK11Q5JSL3 2073 aa9.45□□□□□ -0.9
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C9orf3-220ENST00000489318 C17orf98A8MV24 154 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-220ENST00000489318 SSNA1O43805 119 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-220ENST00000489318 SLC22A5O76082 557 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-220ENST00000489318 RGS11O94810 467 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-220ENST00000489318 IGHV2-5P01817 119 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-220ENST00000489318 HLA-GP17693 338 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-220ENST00000489318 COL8A1P27658 744 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf3-220ENST00000489318 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
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