RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487868.1

CAMSAP1-208, Transcript of calmodulin regulated spectrin associated protein 1, human

TSL 3

Gene CAMSAP1, Length 411 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAMSAP1-208	ENST00000487868	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	ZNF846	Q147U1	533 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	PRR18	Q8N4B5	295 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	ZNF596	Q8TC21	504 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	GALM	Q96C23	342 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	SMR3A	Q99954	134 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	YPEL1	O60688	119 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	TUSC2	O75896	110 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	CD3D	P04234	171 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	IL7	P13232	177 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	HLA-DMA	P28067	261 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	RFX2	P48378	723 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	KLRD1	Q13241	179 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868		Q3ZCU0	254 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	MORN2	Q502X0	79 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	STEAP3	Q658P3	488 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	YPEL2	Q96QA6	119 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	CCDC32	Q9BV29	185 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	RAB9B	Q9NP90	201 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	JPT1	Q9UK76	154 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	AUP1	Q9Y679	476 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868		A0A1W2PPE2	198 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868		A0A1W2PR64	198 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868		A0A1W2PRV1	198 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	FAM172BP	A6NC97	362 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	ODF3B	A8MYP8	253 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	LY6G6D	O95868	133 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	IGLV1-47	P01700	117 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	CTXN2	P0C2S0	81 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	ZNF735	P0CB33	412 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	TBP	P20226	339 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	HRH1	P35367	487 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	ZNF134	P52741	427 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	TAS2R46	P59540	309 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	IFITM3	Q01628	133 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	DYRK1A	Q13627	763 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	CDK10	Q15131	360 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	LTC4S	Q16873	150 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	LEAP2	Q969E1	77 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	AJUBA	Q96IF1	538 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	TSC22D3	Q99576	134 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	PSG11	Q9UQ72	335 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868		M0QYG6	137 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	ITGB1BP1	O14713	200 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	BET1	O15155	118 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	SLC31A2	O15432	143 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	PMP2	P02689	132 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	CSF1	P09603	554 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	NFYB	P25208	207 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	TAS2R19	P59542	299 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	ACTBL2	Q562R1	376 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	LINC00311	Q8N616	119 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CAMSAP1-208	ENST00000487868	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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