RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF442Q9H7R0 627 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 SPACA1Q9HBV2 294 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 TUBG2Q9NRH3 451 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 TINAGQ9UJW2 476 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 GTF3C1Q12789 2109 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1W2PR80 420 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 CLEC18AA5D8T8 446 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 C5orf52A6NGY3 159 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 MPPED1O15442 326 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 ANGPTL7O43827 346 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 AGFG2O95081 481 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 PLA2G2AP14555 144 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 RAB5AP20339 215 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 CCNOP22674 350 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 LMO1P25800 156 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 MAS1LP35410 378 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 RBPJQ06330 500 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 TBC1D28Q2M2D7 210 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 MPV17LQ2QL34 196 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 PHLDA2Q53GA4 152 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 C1QL4Q86Z23 238 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF695Q8IW36 515 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 CLEC18CQ8NCF0 446 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 CLCC1Q96S66 551 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 HIPK2Q9H2X6 1198 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 PLK3Q9H4B4 646 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-208ENST00000486964 A0A087WWC5 75 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 CD300LBA8K4G0 201 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 SMPD2O60906 423 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 DFFBO76075 338 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 CECR9P0C854 216 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A6P12236 298 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 AADACP22760 399 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 CA7P43166 264 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 PIGYQ3MUY2 71 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 SLC35G3Q8N808 338 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 HPSE2Q8WWQ2 592 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 KIAA1456Q9P272 454 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1B0GWJ7 208 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF732B4DXR9 585 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 C9JQL5 133 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 H0Y980 276 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 TGOLN2O43493 480 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 WNT2P09544 360 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 RAC2P15153 192 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 SULT1A1P50225 295 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 FGF12P61328 243 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 TLE4Q04727 773 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 FAM27E3Q08E93 113 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 SP6Q3SY56 376 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 C1orf174Q8IYL3 243 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 ZFP82Q8N141 532 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF611Q8N823 705 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 OR56B2PQ8NGI1 322 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 OR5D13Q8NGL4 314 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 CD300LFQ8TDQ1 290 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 S100PBPQ96BU1 408 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 LIME1Q9H400 295 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 WFDC1Q9HC57 220 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 SIRT7Q9NRC8 400 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-208ENST00000486964 RNF150Q9ULK6 438 aa8.13□□□□□ -1.11
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