RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482278.5

TUBGCP2-208, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 2, human

TSL 2

Gene TUBGCP2, Length 3,553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ERVFC1-1	P60608	527 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RAB1A	P62820	205 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TM2D1	Q9BX74	207 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C12orf49	Q9H741	205 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278		A0A0U1RQK1	487 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RAB29	O14966	203 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LINC00614	P0C842	121 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF596	Q8TC21	504 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ABI3	Q9P2A4	366 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RFNG	Q9Y644	331 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C5orf49	A4QMS7	147 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CD5	P06127	495 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CEP250	Q9BV73	2442 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZFP92	A6NM28	416 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278		F8VVB4	439 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278		F8VWA3	439 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HPRT1	P00492	218 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NGF	P01138	241 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278		Q6ZPA2	131 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278		Q6ZSR3	168 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TOMM40L	Q969M1	308 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TMEM18	Q96B42	140 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ATM	Q13315	3056 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	WISP2	O76076	250 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SFT2D2	O95562	160 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PTGER4	P35408	488 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MEOX1	P50221	254 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MMD	Q15546	238 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RNF126	Q9BV68	326 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AKAP13	Q12802	2813 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CIDEA	O60543	219 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC25A4	P12235	298 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TMEM33	P57088	247 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FXYD4	P59646	89 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ELOB	Q15370	118 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SP6	Q3SY56	376 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MS4A10	Q96PG2	267 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SERPINE3	A8MV23	424 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HSPB6	O14558	160 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FPR2	P25090	351 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RBX1	P62877	108 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PMP22	Q01453	160 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ADIRF	Q15847	76 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SP1	P08047	785 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF708	P17019	499 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MUCL1	Q96DR8	90 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRSS50	Q9UI38	385 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FUT9	Q9Y231	359 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LILRA1	O75019	489 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HLA-G	P17693	338 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FUT3	P21217	361 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DUSP1	P28562	367 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TAS2R46	P59540	309 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TUBGCP2-208	ENST00000482278	P2RY6	Q15077	328 aa		10.09	□□□□□ -0.79

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