RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.16□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.16□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.16□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 NAA60Q9H7X0 242 aa6.16□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.16□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.16□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 R4GMQ9 66 aa6.16□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.16□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 FANCMQ8IYD8 2048 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 GAGE12BA1L429 117 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 DIRC3C9JPN6 131 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SMPD2O60906 423 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 GPX1P07203 203 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 GNB3P16520 340 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 GZMHP20718 246 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 GDF1P27539 372 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 MC5RP33032 325 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 PPOXP50336 477 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ERVS71-1P61550 626 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 PPP1CBP62140 327 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 GNB2P62879 340 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ARG2P78540 354 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 UNC119Q13432 240 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 FHL3Q13643 280 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 RUNX3Q13761 415 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ZNF141Q15928 474 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 OR4A47Q6IF82 309 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 OR5P3Q8WZ94 311 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 CALHM2Q9HA72 323 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ALKBH4Q9NXW9 302 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.15□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 VCANP13611 3396 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TMEM189A5PLL7 270 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SHISA7A6NL88 538 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 P2RY10O00398 339 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 DEGS1O15121 323 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MLNRO43193 412 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 S1PR2O95136 353 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CGAP01215 116 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SERPINA7P05543 415 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CRYGCP07315 174 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 WNT2P09544 360 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 CRISP2P16562 243 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 NTSR1P30989 418 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 LGALS7P47929 136 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SLC6A8P48029 635 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 PSMB3P49720 205 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MEOX1P50221 254 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ADIRFQ15847 76 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ASCL4Q6XD76 172 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TMEM25Q86YD3 366 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 UBALD2Q8IYN6 164 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNF709Q8N972 641 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 OR10AC1Q8NH08 325 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 DOK4Q8TEW6 326 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 DYRK2Q92630 601 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.14□□□□□ -1.43
PKP4-211ENST00000481115 ST20Q9HBF5 79 aa6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms