RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462323.5

MUC4-208, Transcript of mucin 4, cell surface associated, human

TSL 5

Gene MUC4, Length 16,197 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC4-208	ENST00000462323	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323		G3V4G9	280 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	PNKD	Q8N490	385 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323		A0A087WWC5	75 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	DEGS1	O15121	323 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	PI3	P19957	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	ERVS71-1	P61550	626 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	CATR1	Q13166	79 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	UBALD1	Q8TB05	177 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	SMIM8	Q96KF7	97 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	FGF21	Q9NSA1	209 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	FGF16	O43320	207 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	PTHLH	P12272	177 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	UQCRFS1	P47985	274 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	RARRES2	Q99969	163 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	PECR	Q9BY49	303 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	TCL1A	P56279	114 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	DHH	O43323	396 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	FUT7	Q11130	342 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	MUCL1	Q96DR8	90 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	GNB4	Q9HAV0	340 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	PRSS50	Q9UI38	385 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	PHLPP1	O60346	1717 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	FOLR3	P41439	243 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	EFNB1	P98172	346 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	PP6455	Q8WZ26	134 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	LHX4	Q969G2	390 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	OR5B21	A6NL26	309 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	RAMP1	O60894	148 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	HSBP1	O75506	76 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	GALR1	P47211	349 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	HLA-B	Q31612	363 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	PIGT	Q969N2	578 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	D2HGDH	Q8N465	521 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	ALS2	Q96Q42	1657 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323		C9JQL5	133 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	TCTA	P57738	103 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	OR4C12	Q96R67	309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	RSG1	Q9BU20	258 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	FUT9	Q9Y231	359 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	LRP12	Q9Y561	859 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	LINC01553	A4QN01	128 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323		G3V3Y1	287 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	ADRA2A	P08913	450 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	CLDN15	P56746	228 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	NEURL1	O76050	574 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323		B5MCH6	92 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	KLF4	O43474	513 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	FUT6	P51993	359 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	FUT3	P21217	361 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	ARG2	P78540	354 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323		A0A1W2PPV9	198 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	RAB40C	Q96S21	281 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	PLPP3	O14495	311 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	SPINK8	P0C7L1	97 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	IGFBP2	P18065	325 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323		A0A1B0GU03	582 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	ST6GAL1	P15907	406 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	CRYBA2	P53672	197 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	COL10A1	Q03692	680 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MUC4-208	ENST00000462323	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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