RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 Q6ZPA2 131 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 STPG2Q8N412 459 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 OR1L1Q8NH94 360 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 ABCG5Q9H222 651 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF137PP52743 207 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 HSD17B12Q53GQ0 312 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 TEX38Q6PEX7 206 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 CEACAM19Q7Z692 300 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 LYPD6Q86Y78 171 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 GALMQ96C23 342 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 ABRACLQ9P1F3 81 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 JPT1Q9UK76 154 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 TPRKBQ9Y3C4 175 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 SRMP19623 302 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 VHLP40337 213 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 RANBP1P43487 201 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 GPR12P47775 334 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 OR2W3Q7Z3T1 314 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 Q8N6K4 173 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 UFD1Q92890 307 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 S1PR3Q99500 378 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 TMEM59Q9BXS4 323 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 LINC00527Q9UJ94 153 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 SLC31A2O15432 143 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 LANCL1O43813 399 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 HTR2CP28335 458 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 HTD2P86397 168 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 MORN2Q502X0 79 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 STEAP1Q9UHE8 339 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 PLXNB1O43157 2135 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 VDAC1P21796 283 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 SOX6P35712 828 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 MYCNOSP40205 109 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF134P52741 427 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 TRAM1Q15629 374 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 SIGIRRQ6IA17 410 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF695Q8IW36 515 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 LINC00482Q8N8I6 264 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 Q8N9W7 124 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 VCX3BQ9H321 246 aa14.84□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CCDC78-204ENST00000439619 ANKRD65E5RJM6 399 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 YPEL1O60688 119 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 ARL6IP5O75915 188 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 BPNT1O95861 308 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 HSMCR30P0CW71 290 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 OR5H8P0DN80 308 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 VSIG8P0DPA2 414 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 CHATP28329 748 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 THBS3P49746 956 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 INSL4Q14641 139 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 C8orf86Q6ZUL3 223 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 OR52L2PQ8NGH6 319 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 YPEL2Q96QA6 119 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.83□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 SLC22A1O15245 554 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 ELANEP08246 267 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 LSAMPQ13449 338 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 FOXE3Q13461 319 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 MMDQ15546 238 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 MOB1BQ7L9L4 216 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 FAAP24Q9BTP7 215 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 PLGRKTQ9HBL7 147 aa14.82□□□□□ -0.04
CCDC78-204ENST00000439619 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms