RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A0B4J203 849 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1W2PPE2 198 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1W2PR64 198 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1W2PRV1 198 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 ODAMA1E959 279 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 ODF3BA8MYP8 253 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 MPIG6BO95866 241 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 CGB3P0DN86 165 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 CGB7P0DN87 165 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGHV1-8P0DP01 117 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARSBP15848 533 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 GLIPR1P48060 266 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 CLDN12P56749 244 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 IFITM3Q01628 133 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 AESQ08117 197 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 OXA1LQ15070 435 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 P2RY14Q15391 338 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 C2orf76Q3KRA6 126 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC22A6Q4U2R8 563 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 C1orf100Q5SVJ3 147 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00596Q86U02 117 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 C17orf50Q8WW18 174 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 ING4Q9UNL4 249 aa8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 FUOMA2VDF0 154 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 METTL21EPA6NDL7 271 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 CENPXA8MT69 81 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 CTDSPLO15194 276 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 MMP23AO75900 390 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 SCGNO76038 276 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 GTF2F2P13984 249 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 SERPINA2P20848 420 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 MADCAM1Q13477 382 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPR176Q14439 515 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 BAK1Q16611 211 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 MPV17LQ2QL34 196 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRBOX4Q5JUW0 171 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM69Q5SWH9 247 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF626Q68DY1 528 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM104Q8NE00 496 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR51D1Q8NGF3 324 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 CFHR4Q92496 578 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 S100A13Q99584 98 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 MMP28Q9H239 520 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 TAS2R3Q9NYW6 316 aa8.74□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A0A6YYH2 397 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 A6NJ64 397 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 CSTBP04080 98 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 GSTT2BP0CG30 244 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 UBBP0CG47 229 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 VSIG8P0DPA2 414 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 RAB6AP20340 208 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 COX7A1P24310 79 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 GDNFP39905 211 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCNJ3P48549 501 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 ASAH1Q13510 395 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 AWAT2Q6E213 333 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 HEPN1Q6WQI6 88 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 SUMF2Q8NBJ7 301 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 FCAMRQ8WWV6 532 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 PTX4Q96A99 478 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q96M66 194 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATG5Q9H1Y0 275 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM133Q9H2Q1 129 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 GHRLQ9UBU3 117 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIF25Q9UIL4 384 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 RAB22AQ9UL26 194 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 SESN1Q9Y6P5 492 aa8.73□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.72□□□□□ -1.01
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A087X0M5 115 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms