RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM30BQ3MIR4 351 aa24.38■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 MZT2AQ6P582 158 aa24.38■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 LDLRAD3Q86YD5 345 aa24.38■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 GALMQ96C23 342 aa24.38■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 APOA1P02647 267 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 GNG10P50151 68 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 HLA-DRB3P79483 266 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 HTD2P86397 168 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 MINOS1Q5TGZ0 78 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 OR52L2PQ8NGH6 319 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 OR10V1Q8NGI7 309 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 MALSU1Q96EH3 234 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 MEGF9Q9H1U4 602 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 MMP28Q9H239 520 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 OR2S2Q9NQN1 319 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 GNG12Q9UBI6 72 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1W2PPE3 182 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 SCTP09683 121 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 ELK1P19419 428 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 HTR1DP28221 377 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 GNMTQ14749 295 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 CNPY1Q3B7I2 92 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 IL1F10Q8WWZ1 152 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 DUX5Q96PT3 197 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 JMJD8Q96S16 334 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 AUNIPQ9H7T9 357 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 ATRQ13535 2644 aa24.37■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa24.36■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa24.36■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 SSX5O60225 188 aa24.36■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 TALDO1P37837 337 aa24.36■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 MAFIPQ8WZ33 124 aa24.36■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 JPT1Q9UK76 154 aa24.36■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 IER3P46695 156 aa24.35■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 SLC9A3R2Q15599 337 aa24.35■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 SSX2Q16385 188 aa24.35■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 DPM3Q9P2X0 92 aa24.35■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 TRDCB7Z8K6 153 aa24.34■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 PTHLHP12272 177 aa24.34■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 DTYMKP23919 212 aa24.34■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF134P52741 427 aa24.34■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 GNG2P59768 71 aa24.34■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 PITPNAQ00169 270 aa24.34■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 Q3ZCU0 254 aa24.34■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 MORN2Q502X0 79 aa24.34■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM69Q5SWH9 247 aa24.34■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 C8orf31Q8N9H6 132 aa24.34■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF439Q8NDP4 499 aa24.34■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 HILPDAQ9Y5L2 63 aa24.34■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 LY6LH3BQJ8 138 aa24.33■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV4-59P01825 116 aa24.33■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 LINC00311Q8N616 119 aa24.33■■□□□ 1.49
PKDCC-202ENST00000401498 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa24.33■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 SLC31A2O15432 143 aa24.33■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 TAS2R20P59543 309 aa24.33■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 Q6ZS49 121 aa24.33■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 SSMEM1Q8WWF3 244 aa24.33■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa24.32■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 LEUTXA8MZ59 168 aa24.32■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 CTDSP2O14595 271 aa24.32■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 YPEL1O60688 119 aa24.32■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 GSTT2P0CG29 244 aa24.32■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 GSTT2BP0CG30 244 aa24.32■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 MNDAP41218 407 aa24.32■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 HERPUD1Q15011 391 aa24.32■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 CT45A1Q5HYN5 189 aa24.32■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 STEAP3Q658P3 488 aa24.32■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 CT45A3Q8NHU0 189 aa24.32■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 CREB3L1Q96BA8 519 aa24.32■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 YPEL2Q96QA6 119 aa24.32■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 MIXL1Q9H2W2 232 aa24.32■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 CLDN34H7C241 214 aa24.31■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 FABP7O15540 132 aa24.31■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 KIR2DS4P43632 304 aa24.31■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 UBA52P62987 128 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 KIR2DS1Q14954 304 aa24.31■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 MCFD2Q8NI22 146 aa24.31■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 OCSTAMPQ9BR26 566 aa24.31■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa24.31■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 TNFRSF19Q9NS68 423 aa24.31■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 SLC23A1Q9UHI7 598 aa24.31■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 PLA1AQ53H76 456 aa24.3■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 OR4A4PQ8NGN8 299 aa24.3■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 OR10X1Q8NGY0 326 aa24.3■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 SSX3Q99909 188 aa24.3■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 OR1A1Q9P1Q5 309 aa24.3■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 POMT1Q9Y6A1 747 aa24.3■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 FAM25AB3EWG3 89 aa24.29■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 FAM25CB3EWG5 89 aa24.29■■□□□ 1.48
PKDCC-202ENST00000401498 FAM25GB3EWG6 89 aa24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms