RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384569.1

SNORD56.6-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.6-201ENST00000384569 RAB7AP51149 207 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 LTC4SQ16873 150 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 ANKRD55Q3KP44 614 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 LRRC10Q5BKY1 277 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 LY6G6FQ5SQ64 297 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 TEX36Q5VZQ5 186 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 Q6ZPA2 131 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 FOXRED2Q8IWF2 684 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF645Q8N7E2 425 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 SLC35G3Q8N808 338 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZBTB34Q8NCN2 500 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 OR8H1Q8NGG4 311 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 OR13A1Q8NGR1 328 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 OR1L1Q8NH94 360 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 UBALD1Q8TB05 177 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 FAM222BQ8WU58 562 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 TIMD4Q96H15 378 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 COQ2Q96H96 371 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 LURAP1Q96LR2 239 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 GAFA1Q96PS6 74 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 MFFQ9GZY8 342 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 RAB1BQ9H0U4 201 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 OR2S2Q9NQN1 319 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 TMEM106BQ9NUM4 274 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 CALYQ9NYX4 217 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 GSKIPQ9P0R6 139 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 UBQLN2Q9UHD9 624 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 TMED3Q9Y3Q3 217 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 PPIAL4AQ9Y536 164 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 MAB21L2Q9Y586 359 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD56.6-201ENST00000384569 IGSF10Q6WRI0 2623 aa4.59□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 TRAV39A0A0B4J263 110 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 A0A1W2PPH5 198 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 K7N7A8 449 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 SIGLEC5O15389 551 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 MPPED1O15442 326 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 ADAM20O43506 726 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 BCL2L11O43521 198 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 NDUFB3O43676 98 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZG16O60844 167 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 ATP6V1G1O75348 118 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF737O75373 536 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 OR2F2O95006 317 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 GOSR1O95249 250 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 MPC2O95563 127 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 CDS2O95674 445 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 TFF1P04155 84 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 IGHV3-43DP0DP04 118 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 IGKV1-13P0DP09 117 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 RPS2P15880 293 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 EPHA1P21709 976 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 PSMB6P28072 239 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 CEACAM6P40199 344 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 GLIPR1P48060 266 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 RAB14P61106 215 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 VAMP2P63027 116 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 HTD2P86397 168 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 OR2F1Q13607 317 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 TMEM187Q14656 261 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 GNMTQ14749 295 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 OPCMLQ14982 345 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 MSMO1Q15800 293 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 Q3ZCU0 254 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 ESCO2Q56NI9 601 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 GGNBP1Q5YKI7 109 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 PRSS54Q6PEW0 395 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 C20orf204Q6ZNR8 217 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 C22orf34Q6ZV56 151 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNF546Q86UE3 836 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 CD177Q8N6Q3 437 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 FAM216BQ8N7L0 139 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 TPRX1Q8N7U7 411 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 LRTM2Q8N967 370 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 ZNRF1Q8ND25 227 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 BVESQ8NE79 360 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 DEFB108BQ8NET1 73 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 OR11H4Q8NGC9 324 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 OR1S1Q8NH92 325 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 ANGPTL6Q8NI99 470 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD56.6-201ENST00000384569 CCL17Q92583 94 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms