RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 FBXL14Q8N1E6 418 aa9.64□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 OR10A7Q8NGE5 316 aa9.64□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 OR10S1Q8NGN2 331 aa9.64□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 BOD1Q96IK1 185 aa9.64□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.64□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF319Q9P2F9 582 aa9.64□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC22A20A6NK97 555 aa9.64□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 SERPINE3A8MV23 424 aa9.64□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 OR4A8P0C604 315 aa9.64□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ANOS1P23352 680 aa9.64□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ECI1P42126 302 aa9.64□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 BRICD5Q6PL45 260 aa9.64□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 WFDC8Q8IUA0 241 aa9.64□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 BEND2Q8NDZ0 799 aa9.64□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ANXA10Q9UJ72 324 aa9.64□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa9.64□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 IGSF23A1L1A6 192 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 A6NNC1 897 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 DHHO43323 396 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 LMO1P25800 156 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 NHLH1Q02575 133 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ADIRFQ15847 76 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 BATFQ16520 125 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 LCN15Q6UWW0 184 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM185AQ8N0U4 392 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ASB10Q8WXI3 467 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 DYRK2Q92630 601 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 LIME1Q9H400 295 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC2A9Q9NRM0 540 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 GPR173Q9NS66 373 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 MSR1P21757 451 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ERVS71-1P61550 626 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 PAX5Q02548 391 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 TLE4Q04727 773 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 P2RY6Q15077 328 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 C20orf196Q8IYI0 205 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 NOXO1Q8NFA2 376 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 FAAP24Q9BTP7 215 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 MED13Q9UHV7 2174 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 C5orf49A4QMS7 147 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 RER1O15258 196 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 IL18BPO95998 194 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 CEACAM16Q2WEN9 425 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 CLDND2Q8NHS1 167 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ABHD3Q8WU67 409 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM171Q8WVE6 324 aa9.63□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ANGPTL7O43827 346 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 DYNLT3P51808 116 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 EDDM3BP56851 147 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 CLN3Q13286 438 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 GJC3Q8NFK1 279 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 NKX2-6A6NCS4 301 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 AQP7P3A6NL99 342 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 MARCH11A6NNE9 402 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 TGOLN2O43493 480 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 HLA-HP01893 362 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF17P17021 662 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 PCBD1P61457 104 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 OR2AE1Q8NHA4 323 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 B4DEV8 164 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 MS4A18H0YCH9 400 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 HBE1P02100 147 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 CD55P08174 381 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 FAHP16930 419 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ARL6IP1Q15041 203 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 MS4A18Q3C1V0 323 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 RDH5Q92781 318 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 KCNK17Q96T54 332 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF665Q9H7R5 613 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 NECAP2Q9NVZ3 263 aa9.62□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 H3BP45 60 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 IFNL4K9M1U5 179 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 OPN1MWP04001 364 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 OPN1MW2P0DN77 364 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 OPN1MW3P0DN78 364 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 IRF2P14316 349 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 PAX1P15863 534 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 RAB4AP20338 218 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 RBPJQ06330 500 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 SYT3Q9BQG1 590 aa9.61□□□□□ -0.87
RPRD1B-201ENST00000373433 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms