RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 TRGC2P03986 189 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 TRGC1P0CF51 173 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 RAB4AP20338 218 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 IGHV1-2P23083 117 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 RND3P61587 244 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 NHLH2Q02577 135 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 ASCL4Q6XD76 172 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 Q6ZS92 163 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 C18orf12Q96KH6 178 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 RARRES2Q99969 163 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 SH3BGRL3Q9H299 93 aa15.9■□□□□ 0.14
SPNS1-204ENST00000352260 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF850A8MQ14 1090 aa15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF727A8MUV8 499 aa15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 PITX3O75364 302 aa15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 C1QL1O75973 258 aa15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 FABP4P15090 132 aa15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 IL2RGP31785 369 aa15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 WNT5AP41221 380 aa15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 ABHD14BQ96IU4 210 aa15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 FAM210BQ96KR6 192 aa15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 Q96M66 194 aa15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 CRIM1Q9NZV1 1036 aa15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 EPG5Q9HCE0 2579 aa15.89■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 GNMTQ14749 295 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 MISP3Q96FF7 219 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 HIST1H2BLQ99880 126 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 IGKV1D-12P01611 117 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 OR5H8P0DN80 308 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 HLA-DRB3P79483 266 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 LIAT1Q6ZQX7 453 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM183AQ8IXX5 376 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 LGI3Q8N145 548 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 DKK4Q9UBT3 224 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 WSB1Q9Y6I7 421 aa15.88■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 LOC400499M0QZD8 3231 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 AHRRA9YTQ3 701 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF732B4DXR9 585 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 K7EM74 188 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 GABRR1P24046 479 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 PRDX4Q13162 271 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 ICAM4Q14773 271 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF343Q6P1L6 599 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 VWA1Q6PCB0 445 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 FBXW12Q6X9E4 464 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 OR2G3Q8NGZ4 309 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 ABHD5Q8WTS1 349 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 BOD1Q96IK1 185 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 APC2O95996 2303 aa15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 URB1O60287 2271 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 CLDN34H7C241 214 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 PHOX2AO14813 284 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 LYZL6O75951 148 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 GCGP01275 180 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 OR5AC1P0C628 307 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 SFTPCP11686 197 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 PIGPP57054 158 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 TGFBR3Q03167 851 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 GFI1BQ5VTD9 330 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 Q6ZT83 130 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 FRZBQ92765 325 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 CTDSP1Q9GZU7 261 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 HSF4Q9ULV5 492 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 OPN1MWP04001 364 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 OPN1MW2P0DN77 364 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 OPN1MW3P0DN78 364 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 SRPXP78539 464 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 FBXL14Q8N1E6 418 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 NAXEQ8NCW5 288 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 PRO1933Q9H354 126 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 C11orf1Q9H5F2 150 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 NECAP2Q9NVZ3 263 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 IL36GQ9NZH8 169 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 AK3Q9UIJ7 227 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 ANXA10Q9UJ72 324 aa15.86■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 DSPP15924 2871 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 H0YL77 283 aa15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SPNS1-204ENST00000352260 CDS2O95674 445 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms