RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 TNFSF13O75888 250 aa17.49■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 PRH1P02810 166 aa17.49■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 NFYBP25208 207 aa17.49■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa17.49■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF585BQ52M93 769 aa17.49■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 Q6ZR03 302 aa17.49■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa17.48■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 IGKV1-5P01602 117 aa17.48■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 KITLGP21583 273 aa17.48■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 OR14J1Q9UGF5 321 aa17.48■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa17.48■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 KPTNQ9Y664 436 aa17.48■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 WRBO00258 174 aa17.47■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 HSPA12AO43301 675 aa17.47■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 CGAP01215 116 aa17.47■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 PPT1P50897 306 aa17.47■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 CXXC4Q9H2H0 198 aa17.47■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 DRAM1Q8N682 238 aa17.47■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 OR2G3Q8NGZ4 309 aa17.47■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM213BQ8TBF2 198 aa17.47■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNS2Q9ULS6 477 aa17.47■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 ZFHX4Q86UP3 3567 aa17.47■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 SEM1Q6ZVN7 128 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM217Q8N7C4 229 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 CACNG5Q9UF02 275 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 TXNL1O43396 289 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 CEACAM6P40199 344 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 PEA15Q15121 130 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 WDR82Q6UXN9 313 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 ACP7Q6ZNF0 438 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF610Q8N9Z0 462 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 STARD4Q96DR4 205 aa17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1B0GWJ7 208 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 AHRRA9YTQ3 701 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 UMAD1C9J7I0 102 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 OR1L1Q8NH94 360 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 C5orf30Q96GV9 206 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 COQ2Q96H96 371 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP5SQ99766 215 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 BCL2L14Q9BZR8 327 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 FZR1Q9UM11 496 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1B0GW64 132 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 C12orf77C9JDV5 145 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 CEACAM1P13688 526 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 TUBG1P23258 451 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 RUNX1Q01196 453 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC35E4Q6ICL7 350 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 SPSB3Q6PJ21 355 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 LFNGQ8NES3 379 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 PRR7Q8TB68 274 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB40CQ96S21 281 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 TUBG2Q9NRH3 451 aa17.45■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 CD200P41217 278 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 OR3A1P47881 315 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 TOLLIPQ9H0E2 274 aa17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 H3BP45 60 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 TFF1P04155 84 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 ETV3LQ6ZN32 361 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 WSB1Q9Y6I7 421 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 ASPMQ8IZT6 3477 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 A6NLC8 198 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 SULT1A1P50225 295 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 MSL2Q9HCI7 577 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 PROCRQ9UNN8 238 aa17.43■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms