RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 HES5Q5TA89 166 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF773Q6PK81 442 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZTK2 550 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 THNSL2Q86YJ6 484 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM89BQ8N5H3 189 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 WNT10AQ9GZT5 417 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNIP1Q9NZI2 227 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPAN15O95858 294 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAPSAO96009 420 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMY1AP04745 511 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMY2AP04746 511 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM106CPP0CH98 169 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALP22466 123 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYL9P24844 172 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 REG1BP48304 166 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMD7P51665 324 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF134P52741 427 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNMTQ14749 295 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMGN3Q15651 99 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 C22orf42Q6IC83 251 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf44Q8N8P7 122 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 STEAP1Q9UHE8 339 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDCD5O14737 125 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL3RAP26951 378 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF137PP52743 207 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLA2G7Q13093 441 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 C2orf76Q3KRA6 126 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 CT45A1Q5HYN5 189 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF880Q6PDB4 577 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52L2PQ8NGH6 319 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 CT45A3Q8NHU0 189 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2S2Q9NQN1 319 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 JPT1Q9UK76 154 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 MOB4Q9Y3A3 225 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV1D-33P01593 117 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV1-33P01594 117 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 VEGFCP49767 419 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM50BP56557 158 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 C2orf68Q2NKX9 166 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCA11PQ4W5N1 156 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 NR2C2APQ86WQ0 139 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMP27Q9H306 513 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 AK3Q9UIJ7 227 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSF4Q9ULV5 492 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFITM5A6NNB3 132 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 M0QZK8 103 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM11P17152 192 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB3BP20337 219 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 HTD2P86397 168 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 HES1Q14469 280 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCTD21Q4G0X4 260 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 MORN2Q502X0 79 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 MOB1BQ7L9L4 216 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 MOB3BQ86TA1 216 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 IZUMO1Q8IYV9 350 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 STUB1Q9UNE7 303 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO24O75426 580 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 RANBP1P43487 201 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 EBI3Q14213 229 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLAC9Q5JTB6 97 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR56B1Q8NGI3 324 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 SETD6Q8TBK2 473 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALMQ96C23 342 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 PECRQ9BY49 303 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0B4J203 849 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMIM30A4D0T7 59 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 YPEL1O60688 119 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 PEX14O75381 377 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 LPLP06858 475 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD28P10747 220 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 HNF4GQ14541 408 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 STEAP3Q658P3 488 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q8N6K4 173 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 C5orf56Q8N8D9 126 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 YPEL2Q96QA6 119 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms