RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 PAX5Q02548 391 aa16.59■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 TEX38Q6PEX7 206 aa16.59■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 TUSC5Q8IXB3 177 aa16.59■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF442Q9H7R0 627 aa16.59■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF286AQ9HBT8 521 aa16.59■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 GJE1A6NN92 205 aa16.59■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 HLA-HP01893 362 aa16.59■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 DTYMKP23919 212 aa16.59■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 TLE4Q04727 773 aa16.59■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 CLN3Q13286 438 aa16.59■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 PIGCQ92535 297 aa16.59■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 SPRY4Q9C004 299 aa16.59■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM242Q9NWH2 141 aa16.59■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 M0R143 59 aa16.58■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 GCGP01275 180 aa16.58■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 SP9P0CG40 484 aa16.58■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 CALHM1Q8IU99 346 aa16.58■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 HS3ST6Q96QI5 342 aa16.58■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
ZNF554-201ENST00000317243 SVILO95425 2214 aa16.58■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa16.58■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 OR6C6A6NF89 314 aa16.58■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 OPN1MWP04001 364 aa16.58■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 OPN1MW2P0DN77 364 aa16.58■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 OPN1MW3P0DN78 364 aa16.58■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 CD59P13987 128 aa16.58■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 Q6ZPA2 131 aa16.58■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 THNSL2Q86YJ6 484 aa16.58■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 OR2M7Q8NG81 312 aa16.58■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa16.58■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 OR51B6Q9H340 312 aa16.58■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa16.58■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 A6NNC1 897 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 NPSP0C0P6 89 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 TDGF1P3P51864 188 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 PMS2P11Q13670 270 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF66Q6ZN08 573 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF695Q8IW36 515 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 OSR2Q8N2R0 312 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 KCNE4Q8WWG9 221 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 SPSB1Q96BD6 273 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 MOB3AQ96BX8 217 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 C11orf1Q9H5F2 150 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF665Q9H7R5 613 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 LAMP3Q9UQV4 416 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 CBY1Q9Y3M2 126 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 TK1P04183 234 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 CST2P09228 141 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 NPBWR2P48146 333 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM208Q9BTX3 173 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 SDF2L1Q9HCN8 221 aa16.57■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 ATMQ13315 3056 aa16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF732B4DXR9 585 aa16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 MPPED1O15442 326 aa16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 ERVS71-1P61550 626 aa16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 VAMP2P63027 116 aa16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF154Q13106 437 aa16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 ODF3L1Q8IXM7 274 aa16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 CPT1CQ8TCG5 803 aa16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 PRRG4Q9BZD6 226 aa16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 SRD5A3Q9H8P0 318 aa16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM50AO95807 157 aa16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 NRASP01111 189 aa16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 PPYP01298 95 aa16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 ESPL1Q14674 2120 aa16.56■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 HBE1P02100 147 aa16.55■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 LHX2P50458 406 aa16.55■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 ARF1P84077 181 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 OR1C1Q15619 314 aa16.55■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 LCN15Q6UWW0 184 aa16.55■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM37Q8WXS4 190 aa16.55■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 IL36RNQ9UBH0 155 aa16.55■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 ADAM20O43506 726 aa16.55■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 PRSS8Q16651 343 aa16.55■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 LRP11Q86VZ4 500 aa16.55■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 STRADBQ9C0K7 418 aa16.55■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 RAB4AP20338 218 aa16.54■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 TLE1Q04724 770 aa16.54■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 MALLQ13021 153 aa16.54■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 PLCXD3Q63HM9 321 aa16.54■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 TBC1D26Q86UD7 250 aa16.54■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 FAM185AQ8N0U4 392 aa16.54■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 OR10J5Q8NHC4 309 aa16.54■□□□□ 0.24
ZNF554-201ENST00000317243 C10orf35Q96D05 121 aa16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms