RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 GLT8D1Q68CQ7 371 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 Q8N9W7 124 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM104Q8NE00 496 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 OR1L1Q8NH94 360 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 NEDD4LQ96PU5 975 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 TAF9BQ9HBM6 251 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 SLC31A2O15432 143 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 RGS11O94810 467 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 CT45A1Q5HYN5 189 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 LAIR2Q6ISS4 152 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 C8orf86Q6ZUL3 223 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 LYPD6Q86Y78 171 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF695Q8IW36 515 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF439Q8NDP4 499 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 CT45A3Q8NHU0 189 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 FAM46BQ96A09 425 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 S1PR3Q99500 378 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 JPT1Q9UK76 154 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 LRRC42Q9Y546 428 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 ACSM3Q53FZ2 586 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 NKAPLQ5M9Q1 402 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 RNLSQ5VYX0 342 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 FKBP14Q9NWM8 211 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 SCN3BQ9NY72 215 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 H0YHG0 523 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 LANCL1O43813 399 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 CDK1P06493 297 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 OR5H8P0DN80 308 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 VDAC1P21796 283 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 SOX6P35712 828 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF134P52741 427 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 GP2P55259 537 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 HTD2P86397 168 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 MORN2Q502X0 79 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 ETV3LQ6ZN32 361 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 PHYHIPQ92561 330 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 GALMQ96C23 342 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 TMED9Q9BVK6 235 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 DNAH3Q8TD57 4116 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 PTGES3LE9PB15 166 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 ELANEP08246 267 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 VHLP40337 213 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 FOXE3Q13461 319 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 DEFB121Q5J5C9 76 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 SIGIRRQ6IA17 410 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM59Q9BXS4 323 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 PLSCR3Q9NRY6 295 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 ABRACLQ9P1F3 81 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC9B-201ENST00000311308 LINC01548A6NM66 108 aa15.89■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 YPEL1O60688 119 aa15.89■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa15.89■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 LSAMPQ13449 338 aa15.89■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 SPHARQ15513 63 aa15.89■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 MMDQ15546 238 aa15.89■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 HSD17B12Q53GQ0 312 aa15.89■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 C18orf65Q6ZTR6 163 aa15.89■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa15.89■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 KCNG3Q8TAE7 436 aa15.89■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 YPEL2Q96QA6 119 aa15.89■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 P2RX4Q99571 388 aa15.89■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 DCLRE1BQ9H816 532 aa15.89■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 ANKRD65E5RJM6 399 aa15.88■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 K7EIL1 84 aa15.88■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 CCL24O00175 119 aa15.88■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 MED22Q15528 200 aa15.88■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 C6orf141Q5SZD1 244 aa15.88■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 OR2AK2Q8NG84 335 aa15.88■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 OR52L2PQ8NGH6 319 aa15.88■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 OR8U1Q8NH10 309 aa15.88■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa15.88■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 STEAP1Q9UHE8 339 aa15.88■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 VSIG8P0DPA2 414 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 SRMP19623 302 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 CHATP28329 748 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 HTR2CP28335 458 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 F2RL1P55085 397 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 RAB25P57735 213 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 KRTAP10-11P60412 298 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 LY6G6FQ5SQ64 297 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 C1orf100Q5SVJ3 147 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 CEACAM19Q7Z692 300 aa15.87■□□□□ 0.13
TTC9B-201ENST00000311308 UFD1Q92890 307 aa15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms