RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000302273.2

VPREB1-201, Transcript of V-set pre-B cell surrogate light chain 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene VPREB1, Length 626 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1-201ENST00000302273 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.25□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TRAV18A0A075B6X5 111 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 A0A0B4J293 547 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 OOSP1A8MZH6 123 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 YPEL1O60688 119 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CCNKO75909 580 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 IGHV1-69P01742 117 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 GNB3P16520 340 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ZBTB25P24278 435 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 HLA-DMAP28067 261 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 PRSS3P35030 304 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CEACAM3P40198 252 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 GNG2P59768 71 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 HMGN3Q15651 99 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 BRICD5Q6PL45 260 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 PLET1Q6UQ28 207 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 FGFRL1Q8N441 504 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 LINC00311Q8N616 119 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 DTX3Q8N9I9 347 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 OR4A4PQ8NGN8 299 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 OR6F1Q8NGZ6 308 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 OR9G1Q8NH87 305 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ARL11Q969Q4 196 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 MALSU1Q96EH3 234 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 KIRREL1Q96J84 757 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 YPEL2Q96QA6 119 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 PCGF1Q9BSM1 259 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 KCNK15Q9H427 330 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TAF9BQ9HBM6 251 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 HIVEP2P31629 2446 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ABCA1O95477 2261 aa7.24□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 C12orf77C9JDV5 145 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 AVPP01185 164 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 IFNA2P01563 188 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 LPLP06858 475 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 FCGR3AP08637 254 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 CCL3L1P16619 93 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 SRD5A1P18405 259 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 SLC6A1P30531 599 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ARHGDIBP52566 201 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 LGALS4P56470 323 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 LOXL3P58215 753 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TAS2R20P59543 309 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 PLA2G7Q13093 441 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 PLA1AQ53H76 456 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ZNF626Q68DY1 528 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ABHD12Q8N2K0 398 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 OR4K15Q8NH41 348 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 JMJD8Q96S16 334 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TAS2R8Q9NYW2 309 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ZNF221Q9UK13 617 aa7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TMEM235A6NFC5 223 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ODF3BA8MYP8 253 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 LEUTXA8MZ59 168 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TOR1AO14656 332 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 NPFFO15130 113 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 FABP7O15540 132 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 IGLV1-47P01700 117 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 HBZP02008 142 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 NAT1P18440 290 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 TBPP20226 339 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 EPHA1P21709 976 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 HTR1DP28221 377 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 BTCP35070 178 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 RAB7AP51149 207 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ACTBP60709 375 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 ACTG1P63261 375 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 DGCR2P98153 550 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 MORN2Q502X0 79 aa7.22□□□□□ -1.25
VPREB1-201ENST00000302273 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms