RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 Q6ZSR3 168 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 TAAR9Q96RI9 348 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 AKAP6Q13023 2319 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 IGLV2-14P01704 120 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 CXCL1P09341 107 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 G6PCP35575 357 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 ARL6IP1Q15041 203 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 SSX9Q7RTT3 188 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 NECAP1Q8NC96 275 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 LEAP2Q969E1 77 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 C10orf35Q96D05 121 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 NXPH2O95156 264 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 CDS2O95674 445 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 IGKV1-5P01602 117 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 WT1P19544 449 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 RPS23P62266 143 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 RAB11AP62491 216 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 EDDM3AQ14507 147 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 FAM201AQ5SY85 155 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 SPSB4Q96A44 273 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 RAB39BQ96DA2 213 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 BIN3Q9NQY0 253 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 H3BQ15 152 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 SP1P08047 785 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 CD59P13987 128 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 PTAFRP25105 342 aa7.34□□□□□ -1.23
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GINS1-201ENST00000262460 FOXF2Q12947 444 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 SPRNQ5BIV9 151 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 NMSQ5H8A3 153 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 VWA1Q6PCB0 445 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 CMTM1Q8IZ96 169 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 SLC25A40Q8TBP6 338 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 TRIB1Q96RU8 372 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 STRADBQ9C0K7 418 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 PLK3Q9H4B4 646 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 CLN8Q9UBY8 286 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-201ENST00000262460 ABCA4P78363 2273 aa7.34□□□□□ -1.24
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GINS1-201ENST00000262460 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.33□□□□□ -1.24
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GINS1-201ENST00000262460 OR2C1O95371 312 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SEC11BP0C7V7 166 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 EGR1P18146 543 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ACP1P24666 158 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 F2RP25116 425 aa7.33□□□□□ -1.24
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GINS1-201ENST00000262460 OR3A1P47881 315 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 MEOX2P50222 304 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SLC10A1Q14973 349 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 TESK1Q15569 626 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 GPR157Q5UAW9 335 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 VHLLQ6RSH7 139 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.33□□□□□ -1.24
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GINS1-201ENST00000262460 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 B4E171 279 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 CA11O75493 328 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 RAB5AP20339 215 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 PMELP40967 661 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 TSPAN7P41732 249 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ERVFRD-1P60508 538 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 IL13RA2Q14627 380 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 RTL6Q6ICC9 239 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-201ENST00000262460 OR1J1Q8NGS3 322 aa7.33□□□□□ -1.24
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