RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 GOSR2O14653 212 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 DUX4L2P0CJ85 424 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 DUX4L3P0CJ86 424 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 DUX4L4P0CJ87 422 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 SELLP14151 372 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 ZNRF1Q8ND25 227 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 DEFB108BQ8NET1 73 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 UBALD1Q8TB05 177 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 C18orf12Q96KH6 178 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 GAFA1Q96PS6 74 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 DUX4Q9UBX2 424 aa14.51□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 ACANP16112 2415 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 A0A0B4J2A0 478 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 LRRC30A6NM36 301 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 C12orf77C9JDV5 145 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 G3V3Q6 166 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM178BH3BS89 294 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 K7N7A8 449 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 MGST3O14880 152 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 SIX6O95475 246 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 DIRAS3O95661 229 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 H2BFSP57053 126 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 FGL1Q08830 312 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 RSRP1Q9BUV0 290 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 CHIAQ9BZP6 476 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM106BQ9NUM4 274 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.5□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa14.49□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 GYPAP02724 150 aa14.49□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 HLA-GP17693 338 aa14.49□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 EDDM3AQ14507 147 aa14.49□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.49□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF788Q6ZQV5 615 aa14.49□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 PRR18Q8N4B5 295 aa14.49□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF561Q8N587 486 aa14.49□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.49□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 OR1L1Q8NH94 360 aa14.49□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.49□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 PPP1R35Q8TAP8 253 aa14.49□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.49□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 PRR13Q9NZ81 148 aa14.49□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa14.49□□□□□ -0.09
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SRSF1-201ENST00000258962 RGS13O14921 159 aa14.48□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 PIGPP57054 158 aa14.48□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.48□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF525Q8N782 197 aa14.48□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 COQ8AQ8NI60 647 aa14.48□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 MRGPRDQ8TDS7 321 aa14.48□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 FAM168AQ92567 244 aa14.48□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 CCL17Q92583 94 aa14.48□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 CCL13Q99616 98 aa14.48□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.48□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.48□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.48□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 KCNIP1Q9NZI2 227 aa14.48□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 ODAMA1E959 279 aa14.47□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 LY6HO94772 140 aa14.47□□□□□ -0.09
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SRSF1-201ENST00000258962 PDLIM4P50479 330 aa14.47□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 PHLDA2Q53GA4 152 aa14.47□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 C6orf183Q5T699 404 aa14.47□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 C1orf87Q8N0U7 546 aa14.47□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 FAM216BQ8N7L0 139 aa14.47□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF665Q9H7R5 613 aa14.47□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 OR2W1Q9Y3N9 320 aa14.47□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 HSPB11Q9Y547 144 aa14.47□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 PPIAL4EA0A075B759 164 aa14.46□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa14.46□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 PPIAL4DF5H284 164 aa14.46□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 CCSO14618 274 aa14.46□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 HBZP02008 142 aa14.46□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 HEXAP06865 529 aa14.46□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 PPIAL4FP0DN26 164 aa14.46□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 P2RX3P56373 397 aa14.46□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 NDUFA5Q16718 116 aa14.46□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.46□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 Q5BKY6 102 aa14.46□□□□□ -0.09
SRSF1-201ENST00000258962 OR5M8Q8NGP6 311 aa14.46□□□□□ -0.09
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