RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 OR4D11Q8NGI4 311 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 PAXXQ9BUH6 204 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TSPAN2O60636 221 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 HYPMO75409 117 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 INSL4Q14641 139 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.29□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 IL19Q9UHD0 177 aa6.29□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 IGHV4-34P06331 123 aa6.28□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 ERVS71-1P61550 626 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 HIST3H3Q16695 136 aa6.28□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 REC114Q7Z4M0 266 aa6.28□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 METTL26Q96S19 204 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.28□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 KLK13Q9UKR3 277 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 A0A1B0GTH9 108 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 FOXS1O43638 330 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 EML2O95834 649 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 PSG2P11465 335 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.28□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 OPN4Q9UHM6 478 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TINAGQ9UJW2 476 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 PILRAQ9UKJ1 303 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 J3QR06 171 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SCGB1A1P11684 91 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 CCL21O00585 134 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.28□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 LEUTXA8MZ59 168 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 RHBDL1O75783 438 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 MGPP08493 103 aa6.28□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 LIMS1P48059 325 aa6.28□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 STARD6P59095 220 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 PCSK4Q6UW60 755 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 STARD4Q96DR4 205 aa6.28□□□□□ -1.4
CPS1-201ENST00000233072 VSIG4Q9Y279 399 aa6.28□□□□□ -1.4
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CPS1-201ENST00000233072 ROM1Q03395 351 aa6.27□□□□□ -1.41
CPS1-201ENST00000233072 PIGYQ3MUY2 71 aa6.27□□□□□ -1.41
CPS1-201ENST00000233072 MMD2Q8IY49 270 aa6.27□□□□□ -1.41
CPS1-201ENST00000233072 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.27□□□□□ -1.41
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CPS1-201ENST00000233072 A0A1W2PQF6 199 aa6.27□□□□□ -1.41
CPS1-201ENST00000233072 TMEM189A5PLL7 270 aa6.27□□□□□ -1.41
CPS1-201ENST00000233072 ZNF735P0CB33 412 aa6.27□□□□□ -1.41
CPS1-201ENST00000233072 FAM157CP0CG43 387 aa6.27□□□□□ -1.41
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CPS1-201ENST00000233072 CD1BP29016 333 aa6.27□□□□□ -1.41
CPS1-201ENST00000233072 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CPS1-201ENST00000233072 GAMTQ14353 236 aa6.27□□□□□ -1.41
CPS1-201ENST00000233072 TTC32Q5I0X7 151 aa6.27□□□□□ -1.41
CPS1-201ENST00000233072 ZNF383Q8NA42 475 aa6.27□□□□□ -1.41
CPS1-201ENST00000233072 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.27□□□□□ -1.41
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