RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 ORAI1Q96D31 301 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 OR4F4Q96R69 305 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 OR5M11Q96RB7 305 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 ETAA1Q9NY74 926 aa7.24□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 A0A1W2PPK0 400 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 C12orf77C9JDV5 145 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 ANKRD65E5RJM6 399 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 PTGES3LE9PB15 166 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 ARL6IP5O75915 188 aa7.23□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 AMY2AP04746 511 aa7.23□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.23□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 GALP22466 123 aa7.23□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 NEK7Q8TDX7 302 aa7.23□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 FAM172BPA6NC97 362 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 SLC17A2O00624 439 aa7.22□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 HSD17B6O14756 317 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 LANCL1O43813 399 aa7.22□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 ACOT13Q9NPJ3 140 aa7.22□□□□□ -1.25
PKP4-218ENST00000629219 ING3Q9NXR8 418 aa7.22□□□□□ -1.25
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PKP4-218ENST00000629219 Q6ZS46 218 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 COMMD1Q8N668 190 aa7.21□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.21□□□□□ -1.26
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