RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 GRINAQ7Z429 371 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 OR5D14Q8NGL3 314 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 KCNG3Q8TAE7 436 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 NAT6Q93015 286 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 ELSPBP1Q96BH3 223 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 ANGPTL4Q9BY76 406 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF576Q9H609 170 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 C5orf63A6NC05 138 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM150CB9EJG8 249 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SH2D1BO14796 132 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF728P0DKX0 622 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ARL4DP49703 201 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 LOXL4Q96JB6 756 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 GABRG3Q99928 467 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 EMC6Q9BV81 110 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PECRQ9BY49 303 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PRO3102Q9H379 93 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 NAA60Q9H7X0 242 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CDS2O95674 445 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 GP1BBP13224 206 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PDLIM4P50479 330 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 OR1D5P58170 312 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ROM1Q03395 351 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2V1Q13404 147 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 VAMP3Q15836 100 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF726P1Q15940 193 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 OR5AS1Q8N127 324 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 OR51I2Q9H344 312 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 MSTNO14793 375 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 DEFA4P12838 97 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 IL3RAP26951 378 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 YPEL5P62699 121 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 IL13RA2Q14627 380 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 D2HGDHQ8N465 521 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 NUDT11Q96G61 164 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 Q9N2K0 584 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 MED29Q9NX70 200 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CADP27708 2225 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PATE3B3GLJ2 98 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
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PTPRT-211ENST00000618610 FUT7Q11130 342 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SPATA45Q537H7 98 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PIGTQ969N2 578 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 OR6C1Q96RD1 312 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PLK3Q9H4B4 646 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SLC2A9Q9NRM0 540 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 HRASP01112 189 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ADMP35318 185 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SLC6A8P48029 635 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 NSDHLQ15738 373 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PRTGQ2VWP7 1150 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 UEVLDQ8IX04 471 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CENPEQ02224 2701 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 J3QW42 95 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ADAM20O43506 726 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ANGPTL7O43827 346 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SERF1AO75920 110 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 HBE1P02100 147 aa7.06□□□□□ -1.28
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