RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604624.6

KCNMA1-223, Transcript of potassium calcium-activated channel subfamily M alpha 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene KCNMA1, Length 11,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNMA1-223	ENST00000604624	CEACAM3	P40198	252 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	LOXL3	P58215	753 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	ZNF273	Q14593	569 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	METTL26	Q96S19	204 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	KLKB1	P03952	638 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	NPC2	P61916	151 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	OXGR1	Q96P68	337 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	NUP98	P52948	1817 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624		J3QR06	171 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	TMEM33	P57088	247 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	OTP	Q5XKR4	325 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	CFAP161	Q6P656	301 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	GATD1	Q8NB37	220 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	MARVELD3	Q96A59	401 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	SLC30A3	Q99726	388 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	AICDA	Q9GZX7	198 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	CHODL	Q9H9P2	273 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624		A0A0U1RRA0	63 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	DGCR2	P98153	550 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	GGTLC2	Q14390	218 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	CADM3	Q8N126	398 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	OSR2	Q8N2R0	312 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	NAT6	Q93015	286 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	MPTX1	A8MV57	137 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	ZNF487	B1APH4	448 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	SOD1	P00441	154 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	WNT1	P04628	370 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	PRF1	P14222	555 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	AVPR2	P30518	371 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	UBE2V2	Q15819	145 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	ORAI1	Q96D31	301 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	PRRX2	Q99811	253 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	GPR35	Q9HC97	309 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	ASPDH	A6ND91	283 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	INS	P01308	110 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	GCA	P28676	217 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	GLRX	P35754	106 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	HTRA3	P83110	453 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	AQP6	Q13520	282 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	PDCD1	Q15116	288 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	OR4X1	Q8NH49	305 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	OR4A5	Q8NH83	315 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	VCX2	Q9H322	139 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	SDHD	O14521	159 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	LIPF	P07098	398 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	PTGIR	P43119	386 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	PPP1R1A	Q13522	171 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	OR4C3	Q8NH37	302 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	PRR7	Q8TB68	274 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	OPN4	Q9UHM6	478 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	LAMB1	P07942	1786 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	GPX5	O75715	221 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	PF4	P02776	101 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	FUT5	Q11128	374 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	ASAH1	Q13510	395 aa		3.62	□□□□□ -1.83
KCNMA1-223	ENST00000604624	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		3.62	□□□□□ -1.83

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