RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591107.6

NPC1-212, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, human

TSL 3

Gene NPC1, Length 890 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPC1-212	ENST00000591107	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	FAM46B	Q96A09	425 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	SLAMF9	Q96A28	289 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	PKIB	Q9C010	78 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	METTL9	Q9H1A3	318 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	HES4	Q9HCC6	221 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107		A0A1W2PP11	408 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	TMEM82	A0PJX8	343 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	C17orf98	A8MV24	154 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	LDLRAD4	O15165	306 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	HTR3B	O95264	441 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	CYB5A	P00167	134 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	SERPINA2	P20848	420 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	CD24	P25063	80 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	TNFSF8	P32971	234 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	QRFP	P83859	136 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	UNC119	Q13432	240 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	RSU1	Q15404	277 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	AANAT	Q16613	207 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	C11orf88	Q6PI97	169 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	ASCL4	Q6XD76	172 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	PXT1	Q8NFP0	134 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	CHST6	Q9GZX3	395 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	BANF2	Q9H503	90 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	RASL12	Q9NYN1	266 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	GHRL	Q9UBU3	117 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107		A0A1W2PPH5	198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	VGLL3	A8MV65	326 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107		F8W735	103 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	F2RL2	O00254	374 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF737	O75373	536 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	PEX14	O75381	377 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	MPIG6B	O95866	241 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	APOA1	P02647	267 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	RAB6A	P20340	208 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	BCL3	P20749	454 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	MPZ	P25189	248 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	LOXL3	P58215	753 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	IL24	Q13007	206 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	MADCAM1	Q13477	382 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF626	Q68DY1	528 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	CNIH2	Q6PI25	160 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107		Q8N2B8	174 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	DTX3	Q8N9I9	347 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	TMEM104	Q8NE00	496 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	CMTM3	Q96MX0	182 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	CST11	Q9H112	138 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	IL36G	Q9NZH8	169 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	RAB22A	Q9UL26	194 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107		K7N7A8	449 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	MMP23A	O75900	390 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	KDM4B	O94953	1096 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF728	P0DKX0	622 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	MGMT	P16455	207 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	DUSP1	P28562	367 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	NPBWR2	P48146	333 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	ERVK11-1	P61568	191 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	GPR176	Q14439	515 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	CCDC190	Q86UF4	302 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	PTX4	Q96A99	478 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF714	Q96N38	554 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	ABCG5	Q9H222	651 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		10.61	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		10.6	□□□□□ -0.71
NPC1-212	ENST00000591107	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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