RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589916.5

BCAS3-223, Transcript of BCAS3, microtubule associated cell migration factor, human

TSL 2

Gene BCAS3, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BCAS3-223	ENST00000589916	ARPC4	P59998	168 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	MEF2D	Q14814	521 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	ZMYND11	Q15326	602 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	STUM	Q69YW2	141 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916		Q6P435	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	GPX8	Q8TED1	209 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	YIPF5	Q969M3	257 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	SEH1L	Q96EE3	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	CCL13	Q99616	98 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	PPA2	Q9H2U2	334 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	CLN8	Q9UBY8	286 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916		A0A1W2PQ09	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916		J3QRK9	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916		K7N7A8	449 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	ZNF205	O95201	554 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	OPN1MW	P04001	364 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	TK1	P04183	234 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	IL7	P13232	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	GZMH	P20718	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	P2RX3	P56373	397 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	TMEM50B	P56557	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	EDDM3B	P56851	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	LMO4	P61968	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	TSPAN5	P62079	268 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	DGCR2	P98153	550 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	PAX5	Q02548	391 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	PLA2G7	Q13093	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	PDCD1	Q15116	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	ZNF79	Q15937	498 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	RGS21	Q2M5E4	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	AVPI1	Q5T686	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	CD177	Q8N6Q3	437 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	OR4K15	Q8NH41	348 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	ENKUR	Q8TC29	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	GAFA1	Q96PS6	74 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	PRRT1	Q99946	306 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCAS3-223	ENST00000589916	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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