RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 TRDCB7Z8K6 153 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 C12orf77C9JDV5 145 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 C15orf65H3BRN8 121 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 J3QRK9 145 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 FABP7O15540 132 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 HBZP02008 142 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 CSF1P09603 554 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 GSTT2BP0CG30 244 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 IL7P13232 177 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 CCL3L1P16619 93 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 NAT1P18440 290 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 GATA3P23771 443 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 GDNFP39905 211 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 OR3A3P47888 321 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 TAS2R46P59540 309 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 TAS2R19P59542 299 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 AP3S2P59780 193 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 ARPC4P59998 168 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 PAX2Q02962 417 aa5.51□□□□□ -1.53
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PRPF8-210ENST00000574217 BAK1Q16611 211 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM30BQ3MIR4 351 aa5.51□□□□□ -1.53
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PRPF8-210ENST00000574217 OR52W1Q6IF63 320 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 KIR3DL3Q8N743 410 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 OR4A4PQ8NGN8 299 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 RFESDQ8TAC1 157 aa5.51□□□□□ -1.53
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PRPF8-210ENST00000574217 TRIM63Q969Q1 353 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 ARL11Q969Q4 196 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM186Q96B77 213 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 GALMQ96C23 342 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 KIRREL1Q96J84 757 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 MMP26Q9NRE1 261 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 ANXA10Q9UJ72 324 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 ABCA1O95477 2261 aa5.51□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa5.5□□□□□ -1.53
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PRPF8-210ENST00000574217 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 INAFM1C9JVW0 142 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 M0R1W7 72 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 BET1O15155 118 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 HSPA12AO43301 675 aa5.5□□□□□ -1.53
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PRPF8-210ENST00000574217 DIRAS3O95661 229 aa5.5□□□□□ -1.53
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PRPF8-210ENST00000574217 SCTP09683 121 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 CTXN2P0C2S0 81 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 GSTT2P0CG29 244 aa5.5□□□□□ -1.53
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PRPF8-210ENST00000574217 DLX6P56179 175 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 ARF6P62330 175 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 HTD2P86397 168 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 LTC4SQ16873 150 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 C17orf58Q2M2W7 97 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 ACTBL2Q562R1 376 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 IGSF11Q5DX21 431 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa5.5□□□□□ -1.53
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PRPF8-210ENST00000574217 STEAP3Q658P3 488 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 HEPN1Q6WQI6 88 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 GLCCI1Q86VQ1 547 aa5.5□□□□□ -1.53
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PRPF8-210ENST00000574217 TOMM5Q8N4H5 51 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM229BQ8NBD8 167 aa5.5□□□□□ -1.53
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PRPF8-210ENST00000574217 OR1L1Q8NH94 360 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 OR10J5Q8NHC4 309 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 UBALD1Q8TB05 177 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 BORCS5Q969J3 196 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 CABLES2Q9BTV7 478 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 LINC00574Q9H8X3 128 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 OR2S2Q9NQN1 319 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 NECAP2Q9NVZ3 263 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 HIF1ANQ9NWT6 349 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 GNG12Q9UBI6 72 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.5□□□□□ -1.53
PRPF8-210ENST00000574217 KCNS2Q9ULS6 477 aa5.5□□□□□ -1.53
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