RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560514.1

TSPAN3-208, Transcript of tetraspanin 3, human

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSPAN3-208	ENST00000560514	TXNL1	O43396	289 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TSPAN3-208	ENST00000560514	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TSPAN3-208	ENST00000560514	ZNF19	P17023	458 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TSPAN3-208	ENST00000560514	RAB9A	P51151	201 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TSPAN3-208	ENST00000560514	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TSPAN3-208	ENST00000560514	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TSPAN3-208	ENST00000560514	ACSM6	Q6P461	480 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TSPAN3-208	ENST00000560514	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TSPAN3-208	ENST00000560514	TMEM104	Q8NE00	496 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TSPAN3-208	ENST00000560514	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TSPAN3-208	ENST00000560514	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TSPAN3-208	ENST00000560514	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TSPAN3-208	ENST00000560514	LGALS12	Q96DT0	336 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TSPAN3-208	ENST00000560514	PELI1	Q96FA3	418 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TSPAN3-208	ENST00000560514	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TSPAN3-208	ENST00000560514	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TSPAN3-208	ENST00000560514	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TSPAN3-208	ENST00000560514	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514		A8MZ25	164 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514		G3V318	75 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	GABRB1	P18505	474 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	GZMH	P20718	246 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	CBR4	Q8N4T8	237 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	LINC00311	Q8N616	119 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	C4orf36	Q96KX1	117 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	PARP11	Q9NR21	331 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	HSPA12A	O43301	675 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	IGLV1-40	P01703	118 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ARSB	P15848	533 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	RAB40B	Q12829	278 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	MMD	Q15546	238 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ARL11	Q969Q4	196 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	TMEM212	A6NML5	194 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ATP6V0E1	O15342	81 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	PAX5	Q02548	391 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ALG8	Q9BVK2	526 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	TNC	P24821	2201 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	SLC25A17	O43808	307 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	IL13RA2	Q14627	380 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	KISS1	Q15726	138 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ELP2	Q6IA86	826 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514		Q8N1Y9	231 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	PXT1	Q8NFP0	134 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	TUBA4B	Q9H853	241 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	STUB1	Q9UNE7	303 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514		A0A087WW49	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	SULT1B1	O43704	296 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ZSCAN26	Q16670	478 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	HAGH	Q16775	308 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	LPCAT4	Q643R3	524 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	GPER1	Q99527	375 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	JAM3	Q9BX67	310 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	RSU1	Q15404	277 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	CCDC58	Q4VC31	144 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ZNF691	Q5VV52	312 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ZNF529	Q6P280	563 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	UBALD1	Q8TB05	177 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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