RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	SRI	P30626	198 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TNFSF8	P32971	234 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	KIR2DS2	P43631	304 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	DGCR2	P98153	550 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	PSG9	Q00887	426 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	RUNX3	Q13761	415 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	CDSN	Q15517	529 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	XAF1	Q6GPH4	301 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	SPACA5	Q96QH8	159 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	JPT2	Q9H910	190 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM100	Q9NV29	134 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483		A0A0B4J2A0	478 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483		A6NDN8	102 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF732	B4DXR9	585 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	BUB3	O43684	328 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ARL6IP5	O75915	188 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	HRAS	P01112	189 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	KRAS	P01116	189 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	CT45A8	P0DMV1	189 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	CT45A9	P0DMV2	189 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	CD58	P19256	250 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	SP4	Q02446	784 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	OR1C1	Q15619	314 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	CNIH2	Q6PI25	160 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483		Q6ZSR6	202 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	RASL10A	Q92737	203 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF681	Q96N22	645 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	PARP11	Q9NR21	331 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	MT-ND6	P03923	174 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ELANE	P08246	267 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM157B	P0CG42	384 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TGFBR1	P36897	503 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ST3GAL1	Q11201	340 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	SBSN	Q6UWP8	590 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	SYT8	Q8NBV8	401 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	PEBP4	Q96S96	227 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	IGHG4	P01861	327 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	IFITM1	P13164	125 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	EDNRA	P25101	427 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	CCR2	P41597	374 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483		Q6ZRG5	221 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	OR4A5	Q8NH83	315 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	MMP26	Q9NRE1	261 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	SCML2	Q9UQR0	700 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	PZP	P20742	1482 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	WDR62	O43379	1518 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483		F6UB75	175 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	H2BFM	P0C1H6	154 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	FGF6	P10767	208 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	GNB3	P16520	340 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	SRD5A1	P18405	259 aa		3.28	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88

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