RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544979.6

ZHX3-211, Transcript of zinc fingers and homeoboxes 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZHX3, Length 3,933 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZHX3-211ENST00000544979 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.96□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 HRKO00198 91 aa6.96□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 ANGPTL7O43827 346 aa6.96□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 PDCD6O75340 191 aa6.96□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 MMP23AO75900 390 aa6.96□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 GZMHP20718 246 aa6.96□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 FOXL1Q12952 345 aa6.96□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.96□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.96□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.96□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 LYPD6Q86Y78 171 aa6.96□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 FGF22Q9HCT0 170 aa6.96□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 ID3Q02535 119 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 BRICD5Q6PL45 260 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 LINC01551Q86U37 167 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 ALG1L2C9J202 215 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 PRRT4C9JH25 899 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 TMEM238C9JI98 176 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 LILRB3O75022 631 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 ADMP35318 185 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 HLA-BQ31612 363 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 TMEM211Q6ICI0 200 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 STPG4Q8N801 248 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 ST8SIA1Q92185 356 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 Q96M66 194 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 TMEM56Q96MV1 263 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 DECR2Q9NUI1 292 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 ALKBH4Q9NXW9 302 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 GJE1A6NN92 205 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 K7EQS6 105 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 TSPAN2O60636 221 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 CCR2P41597 374 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 RPEL1Q2QD12 228 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 KCNE4Q8WWG9 221 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 KCNK17Q96T54 332 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 CST9LQ9H4G1 147 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 CLN8Q9UBY8 286 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 FANCMQ8IYD8 2048 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 BPTFQ12830 3046 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 RER1O15258 196 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 S1PR2O95136 353 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 CD33P20138 364 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 IER3P46695 156 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 THBS3P49746 956 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 ARF6P62330 175 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 C17orf99Q6UX52 265 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 SFRP2Q96HF1 295 aa6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 A0A1W2PQD3 144 aa6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 J3QR89 54 aa6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 SIRPB1O00241 398 aa6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 DEGS1O15121 323 aa6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 ZP4Q12836 540 aa6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 GAPTQ8N292 157 aa6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 CSTL1Q9H114 145 aa6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 CACNG5Q9UF02 275 aa6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 COL4A3Q01955 1670 aa6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.94□□□□□ -1.3
ZHX3-211ENST00000544979 A0A1B0GV72 72 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms