RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 IL3RAP26951 378 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 MED22Q15528 200 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 C6orf141Q5SZD1 244 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 FAM46BQ96A09 425 aa7.17□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 GNG12Q9UBI6 72 aa7.17□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.16□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 PSMB11A5LHX3 300 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 SERPINE3A8MV23 424 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 HSD17B6O14756 317 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 PIN1P1O15428 100 aa7.16□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 LOXL3P58215 753 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 C12orf77C9JDV5 145 aa7.15□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.15□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.15□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 OR1L1Q8NH94 360 aa7.15□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 Q96M66 194 aa7.15□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 ZNF134P52741 427 aa7.14□□□□□ -1.27
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LMO3-222ENST00000540445 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 LIPKQ5VXJ0 399 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 RNLSQ5VYX0 342 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 OR10K2Q6IF99 312 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 REC114Q7Z4M0 266 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 LYPD6Q86Y78 171 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.14□□□□□ -1.27
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