RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 HBE1P02100 147 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 APOC1P02654 83 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 C2P06681 752 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TPM3P06753 285 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM153BP0C7A2 387 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ASAH2BP0C7U1 165 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CFC1P0CG37 223 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DEFB130BP0DP73 79 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DEFB130AP0DP74 79 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SRMP19623 302 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 HTR2AP28223 471 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DCTDP32321 178 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARL3P36405 182 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 VHLP40337 213 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAGEA12P43365 314 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC15A1P46059 708 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRKXP51817 358 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARL4CP56559 192 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAS2R41P59536 307 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DEFB131AP59861 70 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CACNG7P62955 275 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RHOGP84095 191 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM3AP98173 230 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR5I1Q13606 314 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RGNQ15493 299 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MEP1BQ16820 701 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CEACAM21Q3KPI0 293 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 C19orf54Q5BKX5 351 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM76BQ5HYJ3 339 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRBOX4Q5JUW0 171 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC25A30Q5SVS4 291 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 LCN1P1Q5VSP4 162 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANXA8L1Q5VT79 327 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF613Q6PF04 617 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SASS6Q6UVJ0 657 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF562Q6V9R5 426 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MOB3CQ70IA8 216 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKRD46Q86W74 232 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 COMMD2Q86X83 199 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPHB5Q86YW7 130 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00346Q8IVM7 164 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SERPINA12Q8IW75 414 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MSRB3Q8IXL7 192 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLECL1Q8IZS7 167 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZFP41Q8N8Y5 198 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAT8LQ8N9F0 302 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC63Q8NA47 563 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM104Q8NE00 496 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR5A2Q8NGI9 324 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 GIMAP1Q8WWP7 306 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 LZICQ8WZA0 190 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CORO2AQ92828 525 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MISP3Q96FF7 219 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PGAM5Q96HS1 289 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF570Q96NI8 536 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR2A7Q96R45 310 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SORT1Q99523 831 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 UQCC2Q9BRT2 126 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DESI2Q9BSY9 194 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR51I2Q9H344 312 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FBXL15Q9H469 300 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RGCCQ9H4X1 137 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC2A9Q9NRM0 540 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM118AQ9NWS6 357 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF446Q9NWS9 450 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 BABAM2Q9NXR7 383 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CALYQ9NYX4 217 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 ABCD2Q9UBJ2 740 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC7A7Q9UM01 511 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPH3ALQ9UNE2 315 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 FIS1Q9Y3D6 152 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 LHFPL6Q9Y693 200 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 LY96Q9Y6Y9 160 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 U3KQV3 271 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MUC5ACP98088 5654 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 MEIKINA0A087WXM9 373 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1W2PS18 150 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRORSD1PA6NEY8 169 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 A8MT66 165 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 F8VVB4 439 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 F8VWA3 439 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 GOLGA6L22H0YM25 854 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 H7C2Y5 167 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SIRPB1O00241 398 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 SH2D1BO14796 132 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 DFFBO76075 338 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-548P-201ENST00000517083 KDM4BO94953 1096 aa1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms