RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC5A10A0PJK1 596 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 PGPA6NDG6 321 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 PCP4L1A6NKN8 68 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 CD300LBA8K4G0 201 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 M0R378 163 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 ORC5O43913 435 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 IDH1O75874 414 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 TDP2O95551 362 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 DIRAS3O95661 229 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF682O95780 498 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 AK1P00568 194 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 AGTP01019 485 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGKV1D-12P01611 117 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF728P0DKX0 622 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC25A16P16260 332 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF3P17036 446 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRKACAP17612 351 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 GABRG2P18507 467 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 RABIFP47224 123 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 SERPINB8P50452 374 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 AQP4P55087 323 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 FXYD6P3P58550 94 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 IDI1Q13907 227 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 CEACAM21Q3KPI0 293 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPRNQ5BIV9 151 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 C6orf226Q5I0X4 101 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 MARCH3Q86UD3 253 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC30A8Q8IWU4 369 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 IQCKQ8N0W5 287 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 YIPF7Q8N8F6 280 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPATA4Q8NEY3 305 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR5AR1Q8NGP9 310 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR5K2Q8NHB8 316 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 SGMS2Q8NHU3 365 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 RLN3Q8WXF3 142 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 GTF2H4Q92759 462 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 MGLLQ99685 303 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 MIEN1Q9BRT3 115 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPXQ9BT56 116 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 REEP1Q9H902 201 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 WASHC3Q9Y3C0 194 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 KIF3AQ9Y496 699 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 MTCH2Q9Y6C9 303 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 CECR2Q9BXF3 1484 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 DOCK3Q8IZD9 2030 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 DMDP11532 3685 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 LOC285556D6RIA3 1793 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 STRCQ7RTU9 1775 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 C5orf49A4QMS7 147 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 SMCO2A6NFE2 343 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR2T8A6NH00 312 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARGFXA6NJG6 315 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 M0R2N4 97 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 NDUFAB1O14561 156 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 BPGMP07738 259 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANXA5P08758 320 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 UCHL1P09936 223 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 AKR1C2P52895 323 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 TAS2R20P59543 309 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 TFDP2Q14188 446 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPR176Q14439 515 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRAMEF20Q5VT98 475 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 TTC23LQ6PF05 361 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 WDR82Q6UXN9 313 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 SCGB1D4Q6XE38 83 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 TPGS1Q6ZTW0 290 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 CLEC20AQ6ZU45 233 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 GKN2Q86XP6 184 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 C9orf163Q8N9P6 203 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 PXT1Q8NFP0 134 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 LYPD6BQ8NI32 183 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 AQP3Q92482 292 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAB1CQ92928 201 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATP6V1E2Q96A05 226 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC127Q96BQ5 260 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 RCN3Q96D15 328 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 REEP6Q96HR9 211 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 PGLYRP3Q96LB9 341 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 OLFM3Q96PB7 478 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANAPC13Q9BS18 74 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM43Q9BTV4 400 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-287P-201ENST00000516230 SDHAF3Q9NRP4 125 aa-0.92□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms