RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 AQP5P55064 265 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 DSTNP60981 165 aa3.35□□□□□ -1.87
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PDE4D-217ENST00000509355 RPL8P62917 257 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 SCRN3Q0VDG4 424 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 SKP2Q13309 424 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF146Q15072 292 aa3.35□□□□□ -1.87
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PDE4D-217ENST00000509355 THEM4Q5T1C6 240 aa3.35□□□□□ -1.87
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PDE4D-217ENST00000509355 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
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PDE4D-217ENST00000509355 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa3.35□□□□□ -1.87
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PDE4D-217ENST00000509355 TMEM246Q9BRR3 403 aa3.35□□□□□ -1.87
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PDE4D-217ENST00000509355 MFFQ9GZY8 342 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 PIGUQ9H490 435 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 A0A1B0GVI7 797 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 AIREO43918 545 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 HSBP1O75506 76 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 FARS2O95363 451 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 LHBP01229 141 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 FGGP02679 453 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
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PDE4D-217ENST00000509355 KRT16P08779 473 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 CXCR1P25024 350 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 DCKP27707 260 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 MPV17P39210 176 aa3.34□□□□□ -1.87
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PDE4D-217ENST00000509355 DAP3P51398 398 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 PSMD7P51665 324 aa3.34□□□□□ -1.87
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PDE4D-217ENST00000509355 VMO1Q7Z5L0 202 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
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PDE4D-217ENST00000509355 JAGN1Q8N5M9 183 aa3.34□□□□□ -1.87
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF781Q8N8C0 355 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-217ENST00000509355 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.34□□□□□ -1.87
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PDE4D-217ENST00000509355 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
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PDE4D-217ENST00000509355 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
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PDE4D-217ENST00000509355 CRABP2P29373 138 aa3.33□□□□□ -1.88
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PDE4D-217ENST00000509355 TSPAN5P62079 268 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 ST3GAL3Q11203 375 aa3.33□□□□□ -1.88
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