RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492728.1

CHD1L-209, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1 like, humanhuman

TSL 2

Gene CHD1L, Length 662 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1L-209ENST00000492728 PACRGLQ8N7B6 248 aa14.55□□□□□ -0.08
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CHD1L-209ENST00000492728 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.55□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 SERPINE3A8MV23 424 aa14.54□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 ORC5O43913 435 aa14.54□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF134P52741 427 aa14.54□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 INSL4Q14641 139 aa14.54□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 C8orf86Q6ZUL3 223 aa14.54□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.54□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
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CHD1L-209ENST00000492728 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.54□□□□□ -0.08
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CHD1L-209ENST00000492728 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
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CHD1L-209ENST00000492728 CKLFQ9UBR5 152 aa14.54□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa14.53□□□□□ -0.08
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CHD1L-209ENST00000492728 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 AWAT2Q6E213 333 aa14.53□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 RAB12Q6IQ22 244 aa14.53□□□□□ -0.08
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CHD1L-209ENST00000492728 STPG2Q8N412 459 aa14.53□□□□□ -0.08
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CHD1L-209ENST00000492728 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.53□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 ETAA1Q9NY74 926 aa14.53□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CHD1L-209ENST00000492728 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.52□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 SC5DO75845 299 aa14.52□□□□□ -0.09
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CHD1L-209ENST00000492728 MGMTP16455 207 aa14.52□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 CELP19835 753 aa14.52□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 GPR12P47775 334 aa14.52□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 THBS3P49746 956 aa14.52□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF137PP52743 207 aa14.52□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 TAS2R43P59537 309 aa14.52□□□□□ -0.09
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CHD1L-209ENST00000492728 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.52□□□□□ -0.09
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CHD1L-209ENST00000492728 LCNL1Q6ZST4 164 aa14.52□□□□□ -0.09
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CHD1L-209ENST00000492728 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.52□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 DUX3Q96PT4 197 aa14.52□□□□□ -0.09
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CHD1L-209ENST00000492728 MED21Q13503 144 aa14.51□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 GPR176Q14439 515 aa14.51□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 STX19Q8N4C7 294 aa14.51□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa14.51□□□□□ -0.09
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CHD1L-209ENST00000492728 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.51□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 C8orf4Q9NR00 106 aa14.51□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa14.51□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.51□□□□□ -0.09
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CHD1L-209ENST00000492728 CD1BP29016 333 aa14.5□□□□□ -0.09
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CHD1L-209ENST00000492728 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.5□□□□□ -0.09
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CHD1L-209ENST00000492728 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.5□□□□□ -0.09
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CHD1L-209ENST00000492728 KCNK15Q9H427 330 aa14.5□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 GNG12Q9UBI6 72 aa14.5□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 FAM90A10PA6NDY2 464 aa14.49□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 FAM90A7PA6NKC0 464 aa14.49□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa14.49□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CHD1L-209ENST00000492728 C6orf183Q5T699 404 aa14.49□□□□□ -0.09
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