RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491954.5

CIZ1-223, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 955 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-223	ENST00000491954	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	MED28	Q9H204	178 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	OR51J1	Q9H342	316 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	GHITM	Q9H3K2	345 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	BEX1	Q9HBH7	125 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	ING3	Q9NXR8	418 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	GPR132	Q9UNW8	380 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954		A0A0B4J293	547 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954		K7N7A8	449 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	NDUFA2	O43678	99 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF737	O75373	536 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	HPX	P02790	462 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	SCT	P09683	121 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	GZMH	P20718	246 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	FCGR2C	P31995	323 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	OR3A1	P47881	315 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	HLA-DRB3	P79483	266 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	AES	Q08117	197 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	C4orf46	Q504U0	113 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	FAM201A	Q5SY85	155 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	C6orf183	Q5T699	404 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	CD276	Q5ZPR3	534 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	AKAP14	Q86UN6	197 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	DTX2	Q86UW9	622 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	NEURL2	Q9BR09	285 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	METRN	Q9UJH8	293 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF222	Q9UK12	451 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	FAM172BP	A6NC97	362 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	OR5H14	A6NHG9	310 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	SSNA1	O43805	119 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	CCNK	O75909	580 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	FSTL3	O95633	263 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	CD8A	P01732	235 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	OR4E1	P0C645	316 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	PGAM2	P15259	253 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	NPY4R	P50391	375 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	UCP3	P55916	312 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	HERV-K104	P61576	105 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	IL13RA1	P78552	427 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	STUM	Q69YW2	141 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	C11orf88	Q6PI97	169 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954		Q6ZPA2	131 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	RAB9B	Q9NP90	201 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM160	Q9NX00	188 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	OPN4	Q9UHM6	478 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	VSIG4	Q9Y279	399 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	DYSF	O75923	2080 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	BET1	O15155	118 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	NDUFS7	O75251	213 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF205	O95201	554 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	GYPA	P02724	150 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	HMGN3	Q15651	99 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	IGSF11	Q5DX21	431 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF626	Q68DY1	528 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CIZ1-223	ENST00000491954	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		10.23	□□□□□ -0.77

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