RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 BET1O15155 118 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 GPR37O15354 613 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 NDUFB3O43676 98 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 NDUFS7O75251 213 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 RLN1P04808 185 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 OR4E1P0C645 316 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 AADACP22760 399 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 EDDM3BP56851 147 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF841Q6ZN19 808 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 SLC38A6Q8IZM9 456 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 SPICQ8N5J4 248 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF565Q8N9K5 539 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 OR1L1Q8NH94 360 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 OR10J5Q8NHC4 309 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 GALMQ96C23 342 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 DCTN5Q9BTE1 182 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 RAB9BQ9NP90 201 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 TAS2R3Q9NYW6 316 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 CALYQ9NYX4 217 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 OR1A1Q9P1Q5 309 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 JPT1Q9UK76 154 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 OR2W1Q9Y3N9 320 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 hADV38S2A0JD32 116 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 HMX3A6NHT5 357 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 DVL1O14640 695 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 SPINT2O43291 252 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 IGHV4-39P01824 125 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF728P0DKX0 622 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 RPS2P15880 293 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 ZBTB25P24278 435 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 HERV-K104P61576 105 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 C17orf58Q2M2W7 97 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 C11orf91Q3C1V1 193 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 LY6G6FQ5SQ64 297 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 FGFRL1Q8N441 504 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 OR10A7Q8NGE5 316 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 ZFAND1Q8TCF1 268 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 CAPSLQ8WWF8 208 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 NEURL2Q9BR09 285 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 OR51J1Q9H342 316 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF69Q9UC07 566 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 MIOXQ9UGB7 285 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 COL12A1Q99715 3063 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 LRBAP50851 2863 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 FAM172BPA6NC97 362 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 ITGB1BP1O14713 200 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 PPIHO43447 177 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 WNT2P09544 360 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 IGKV1-13P0DP09 117 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 NDUFB7P17568 137 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 IL2RGP31785 369 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 LOXL3P58215 753 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 RND3P61587 244 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 BAMBIQ13145 260 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 DHRS2Q13268 280 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 PPP1R1AQ13522 171 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 MSMO1Q15800 293 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 AVPI1Q5T686 147 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 CD276Q5ZPR3 534 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 LPCAT3Q6P1A2 487 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 TMED4Q7Z7H5 227 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 LYG2Q86SG7 212 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 LDLRAD3Q86YD5 345 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 OR52M1Q8NGK5 317 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 C8orf46Q8TAG6 207 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 IL1F10Q8WWZ1 152 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 TOMM40LQ969M1 308 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 ARL11Q969Q4 196 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 SEC22CQ9BRL7 303 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 BEX2Q9BXY8 128 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 BEX1Q9HBH7 125 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 C19orf12Q9NSK7 152 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 RDH8Q9NYR8 311 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 CLN8Q9UBY8 286 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf3-220ENST00000489318 TENM4Q6N022 2769 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms