RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	DYRK2	Q92630	601 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	S100PBP	Q96BU1	408 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	NEU1	Q99519	415 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	RASL12	Q9NYN1	266 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PR80	420 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247		L7N2F9	121 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2H2	O95918	312 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	PPY	P01298	95 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	IFNA2	P01563	188 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	IFNA7	P01567	189 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	CRYAA	P02489	173 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TK1	P04183	234 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	PGAM2	P15259	253 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	AADAC	P22760	399 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	PSMB6	P28072	239 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	GCH1	P30793	250 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	FCGR2C	P31995	323 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SERPINF1	P36955	418 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SRPX	P78539	464 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	HLA-DRB3	P79483	266 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SORD	Q00796	357 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR82	Q6UXN9	313 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TMUB2	Q71RG4	321 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC51B	Q86UW2	128 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	MUCL1	Q96DR8	90 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF488	Q96MN9	340 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM56	Q96MV1	263 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM165	Q9HC07	324 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	MED12L	Q86YW9	2145 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247		H0YIZ8	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247		H0YL77	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	CDIPT	O14735	213 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SH2D1B	O14796	132 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	NXPH2	O95156	264 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	HAND1	O96004	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	LHB	P01229	141 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	CD55	P08174	381 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	GCSH	P23434	173 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	PTAFR	P25105	342 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	UCP1	P25874	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	GNRHR	P30968	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	PIGP	P57054	158 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	HERV-K104	P61576	105 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RBPJ	Q06330	500 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	BAMBI	Q13145	260 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB32	Q13637	225 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATG4A-208	ENST00000489247	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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