RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486596.5

NECTIN3-208, Transcript of nectin cell adhesion molecule 3, human

TSL 5

Gene NECTIN3, Length 732 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECTIN3-208	ENST00000486596	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	PP6455	Q8WZ26	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	OR5B12	Q96R08	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	METTL15	A6NJ78	407 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596		H0YJX3	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596		I3L521	148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	SERPINA3	P01011	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	IGHG4	P01861	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	ANXA8	P13928	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	GP9	P14770	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	VDAC1	P21796	283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	PRKACB	P22694	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	DAP	P51397	102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	INSL3	P51460	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	ZP1	P60852	638 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	ISL1	P61371	349 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	ODF1	Q14990	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	TP53I3	Q53FA7	332 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	SPSB1	Q96BD6	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	FGGY	Q96C11	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	C10orf35	Q96D05	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	ASB9	Q96DX5	294 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	KCTD7	Q96MP8	289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	S1PR3	Q99500	378 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596		G3V318	75 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	DEGS1	O15121	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	SLC31A2	O15432	143 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	MPZL2	O60487	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	SAP30	O75446	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	SULT1C4	O75897	302 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	IGF1	P05019	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	OR8U8	P0C7N1	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	MAL	P21145	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	HTR1F	P30939	366 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	F2RL1	P55085	397 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	ZNF85	Q03923	595 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	ZNF616	Q08AN1	781 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	C12orf73	Q69YU5	71 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	FAHD1	Q6P587	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NECTIN3-208	ENST00000486596	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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